More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0476 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0476  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 639 aa  1215    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  37 
 
 		 993 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  34.1 
 
 		 1027 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.93 
 
 		 931 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  33.15 
 
 		 983 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  33.63 
 
 		 1108 aa  201  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  33.09 
 
 		 1010 aa  200  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  36.16 
 
 		 1021 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 1011 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.09 
 
 		 1088 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  35.94 
 
 		 1008 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  34.1 
 
 		 1030 aa  193  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 654 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.16 
 
 		 946 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  33.09 
 
 		 956 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.24 
 
 		 496 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 		 913 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  34.9 
 
 		 1003 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.87 
 
 		 1013 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  33.1 
 
 		 990 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 992 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  31.71 
 
 		 928 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.63 
 
 		 990 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.77 
 
 		 919 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.09 
 
 		 970 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 1020 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 1071 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  35.12 
 
 		 1138 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.16 
 
 		 1022 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  27.35 
 
 		 621 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.3 
 
 		 1017 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.86 
 
 		 921 aa  153  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 971 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 1048 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  43.67 
 
 		 1014 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  44.81 
 
 		 788 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  42.35 
 
 		 1003 aa  144  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 621 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  29.57 
 
 		 981 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  44.83 
 
 		 921 aa  140  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 950 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  30.43 
 
 		 1000 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  40.71 
 
 		 995 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 926 aa  137  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  43.35 
 
 		 1025 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  38.96 
 
 		 378 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  40.34 
 
 		 1003 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  33.15 
 
 		 915 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.43 
 
 		 1092 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  43.35 
 
 		 850 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.35 
 
 		 965 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  39.1 
 
 		 1125 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  39.76 
 
 		 790 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.62 
 
 		 940 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 957 aa  124  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 271 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  36.26 
 
 		 919 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.45 
 
 		 1058 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  37.66 
 
 		 370 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  42.15 
 
 		 908 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  40.95 
 
 		 963 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  39.57 
 
 		 1033 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 934 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 1158 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 915 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 1100 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 1186 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 952 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 968 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 910 aa  117  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  29.64 
 
 		 937 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38 
 
 		 1102 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  39.51 
 
 		 964 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 276 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.4 
 
 		 960 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  35.57 
 
 		 967 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  42.61 
 
 		 962 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 		 833 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  39.27 
 
 		 1004 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  39.84 
 
 		 982 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  40.18 
 
 		 757 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  39.24 
 
 		 993 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  40.34 
 
 		 797 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 1097 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.14 
 
 		 1042 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 981 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 268 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.54 
 
 		 1017 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  42.8 
 
 		 775 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.4 
 
 		 1103 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  40.38 
 
 		 715 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  36.93 
 
 		 755 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.04 
 
 		 1055 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.6 
 
 		 1072 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  38.19 
 
 		 1054 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  35.15 
 
 		 1123 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 941 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  28.41 
 
 		 597 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  41.03 
 
 		 965 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  37.55 
 
 		 775 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>