233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4209 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 
271 aa  538  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  54.07 
 
 
597 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  52.24 
 
 
602 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3688  transcriptional regulator, SARP family  52.87 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240093  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  42.86 
 
 
378 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.06 
 
 
921 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.01 
 
 
1088 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  37.16 
 
 
1025 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 
1022 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  42.34 
 
 
960 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.46 
 
 
950 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.75 
 
 
654 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 
1000 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  40.49 
 
 
992 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  37.6 
 
 
1071 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 
934 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  38.52 
 
 
981 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  38.27 
 
 
989 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 
1108 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 
1058 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  36.11 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 
453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  38.71 
 
 
622 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  36.29 
 
 
1003 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  38.46 
 
 
1733 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  35.94 
 
 
833 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  37.45 
 
 
979 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 
956 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  37.96 
 
 
1020 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.68 
 
 
1043 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.76 
 
 
992 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.3 
 
 
1093 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.77 
 
 
981 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 
1158 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 
928 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  38.21 
 
 
954 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  32.27 
 
 
621 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 
1004 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.77 
 
 
1339 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 
1021 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.32 
 
 
919 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.32 
 
 
996 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 
1058 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  37.55 
 
 
910 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.33 
 
 
1092 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 
1005 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  33.6 
 
 
968 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  34.5 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.01 
 
 
952 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 
915 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  34.41 
 
 
1123 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0476  transcriptional regulator, SARP family  35.1 
 
 
639 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.36 
 
 
1048 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  35.46 
 
 
1072 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 
990 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  35.92 
 
 
1028 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.1 
 
 
496 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  36.6 
 
 
1022 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  37.4 
 
 
1123 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  35.42 
 
 
370 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  34.25 
 
 
946 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 
940 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.75 
 
 
926 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 
385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  32.38 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.66 
 
 
1125 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.63 
 
 
957 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.87 
 
 
631 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.29 
 
 
1100 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 
1003 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  33.2 
 
 
1055 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  34.02 
 
 
1042 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 
941 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.1 
 
 
1017 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.05 
 
 
965 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 
993 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  31.64 
 
 
388 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  34.98 
 
 
268 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.27 
 
 
1319 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.85 
 
 
990 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 
1030 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.09 
 
 
931 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  35.8 
 
 
935 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 
930 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 
1025 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  32.45 
 
 
1186 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.29 
 
 
1103 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 
266 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  30.89 
 
 
621 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  34.18 
 
 
943 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 
1013 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.41 
 
 
969 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  36.33 
 
 
666 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.5 
 
 
907 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  32.78 
 
 
995 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  32.79 
 
 
1090 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 
1049 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 
1011 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>