More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5104 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5104  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 994 aa  1932    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  29.88 
 
 		 943 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  33.46 
 
 		 963 aa  171  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.98 
 
 		 952 aa  166  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  34.04 
 
 		 1110 aa  165  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 941 aa  164  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.09 
 
 		 957 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 943 aa  159  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  34.46 
 
 		 1056 aa  158  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  31.79 
 
 		 1158 aa  155  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  31.88 
 
 		 1058 aa  154  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  27.89 
 
 		 1018 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  28.73 
 
 		 1058 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  32.49 
 
 		 1102 aa  149  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 980 aa  147  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  30.71 
 
 		 1042 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  30.88 
 
 		 1000 aa  145  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  35.78 
 
 		 907 aa  145  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  29.96 
 
 		 960 aa  144  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 		 1093 aa  144  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  31.29 
 
 		 1125 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  29.83 
 
 		 1100 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 1005 aa  141  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  27.66 
 
 		 1049 aa  141  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.24 
 
 		 919 aa  140  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  30.64 
 
 		 1072 aa  138  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  30.1 
 
 		 1036 aa  137  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  32.69 
 
 		 950 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  31.13 
 
 		 1055 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  30.09 
 
 		 1092 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  30.74 
 
 		 969 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 930 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  29.84 
 
 		 964 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 1043 aa  132  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  25.52 
 
 		 999 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  28.96 
 
 		 1103 aa  129  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  30.04 
 
 		 990 aa  128  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  30.76 
 
 		 940 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  31.32 
 
 		 1087 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01160  predicted ATPase  30.13 
 
 		 892 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  28.97 
 
 		 1050 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  28.77 
 
 		 1066 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  29.09 
 
 		 921 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  31.05 
 
 		 1186 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  29.54 
 
 		 1010 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  24.87 
 
 		 816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  27.46 
 
 		 981 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  29.72 
 
 		 1017 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  34.01 
 
 		 971 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  39.38 
 
 		 1021 aa  116  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  27.9 
 
 		 630 aa  115  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  31.14 
 
 		 1025 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  40.19 
 
 		 1141 aa  114  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.98 
 
 		 910 aa  114  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  31.23 
 
 		 931 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  29.75 
 
 		 983 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  29.93 
 
 		 908 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 726 aa  111  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 906 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  29.98 
 
 		 970 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.31 
 
 		 921 aa  109  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  30.02 
 
 		 1082 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 1097 aa  109  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  26.53 
 
 		 1014 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 621 aa  108  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.74 
 
 		 1017 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  28.6 
 
 		 982 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  29.29 
 
 		 1030 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  28.53 
 
 		 1100 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  28.26 
 
 		 996 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 910 aa  105  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 654 aa  104  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  26.29 
 
 		 1022 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.04 
 
 		 965 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  33.39 
 
 		 1028 aa  102  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 798 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  29.59 
 
 		 621 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  27.8 
 
 		 1064 aa  101  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  29.68 
 
 		 1049 aa  101  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  26.39 
 
 		 630 aa  100  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  31.36 
 
 		 370 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 1071 aa  99.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3481  SARP family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 277 aa  99.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  29.35 
 
 		 631 aa  99.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 922 aa  99.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  28.67 
 
 		 1003 aa  99.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 1048 aa  99.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 928 aa  99  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  27.48 
 
 		 1056 aa  99  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  27.73 
 
 		 1027 aa  98.6  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  28.06 
 
 		 992 aa  98.2  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  29.74 
 
 		 990 aa  98.6  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  28.02 
 
 		 934 aa  98.2  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  27.74 
 
 		 992 aa  98.2  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  28.69 
 
 		 1088 aa  97.8  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  25.04 
 
 		 872 aa  97.8  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 1064 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  35.17 
 
 		 1013 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  29.26 
 
 		 1003 aa  96.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  34.66 
 
 		 907 aa  96.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>