223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3481 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3481  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 1013 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 950 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  35.57 
 
 		 1123 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 1022 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.28 
 
 		 921 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.39 
 
 		 981 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  33.96 
 
 		 1092 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  33.09 
 
 		 1125 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.31 
 
 		 919 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5104  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 994 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 621 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.12 
 
 		 1146 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  31.13 
 
 		 1093 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33.85 
 
 		 1000 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 1020 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 		 1005 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  36.57 
 
 		 1110 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.5 
 
 		 1049 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  34.92 
 
 		 1186 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  30.71 
 
 		 833 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  37.39 
 
 		 1056 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 969 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  34.91 
 
 		 1021 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.76 
 
 		 940 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 990 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.03 
 
 		 1121 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.36 
 
 		 907 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  32 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  32.14 
 
 		 1014 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  32.54 
 
 		 388 aa  99  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 941 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 		 1158 aa  98.6  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.94 
 
 		 962 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 964 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  31.8 
 
 		 1055 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  37.99 
 
 		 919 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.23 
 
 		 957 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 965 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  30.35 
 
 		 611 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.12 
 
 		 921 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 622 aa  95.9  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 760 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.86 
 
 		 992 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  32.02 
 
 		 1025 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  32.18 
 
 		 1102 aa  95.5  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 1071 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 628 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 971 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  33.87 
 
 		 1025 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 1043 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.17 
 
 		 1339 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  30.77 
 
 		 655 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  31.01 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  30.24 
 
 		 453 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  31.2 
 
 		 1088 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 968 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 1100 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 930 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.43 
 
 		 934 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  30.53 
 
 		 1003 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.91 
 
 		 996 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 1022 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  29.52 
 
 		 1733 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 654 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  31.73 
 
 		 967 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  31.62 
 
 		 1042 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  29.92 
 
 		 1004 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  31.1 
 
 		 1103 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  31.4 
 
 		 1033 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 		 1030 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 621 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  29.64 
 
 		 989 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  31.28 
 
 		 994 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2444  SARP family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  29.66 
 
 		 379 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 979 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.95 
 
 		 631 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  29.8 
 
 		 1018 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  30.35 
 
 		 1058 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  31.3 
 
 		 1118 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  28.63 
 
 		 946 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 983 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.12 
 
 		 981 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  27.49 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  33.08 
 
 		 676 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 908 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  28.85 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  33.2 
 
 		 1058 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  30.65 
 
 		 931 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  33.09 
 
 		 1048 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 786 aa  82  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  29.73 
 
 		 1699 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  30.73 
 
 		 960 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  34.98 
 
 		 1087 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>