More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0978 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  48.65 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.9 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  37.73 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  37.67 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.87 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  35.94 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  35.94 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.91 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  36.87 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.27 
 
 		 236 aa  148  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  35.96 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 209 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  34.56 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  35.02 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  36.11 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  35.02 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.01 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.01 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 242 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 218 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  37.9 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  38.43 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 211 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.94 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.91 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>