155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3421 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  100 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  35.5 
 
 		 1204 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  35.06 
 
 		 1145 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  32.24 
 
 		 1163 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  32.05 
 
 		 1108 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 775 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 1193 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.14 
 
 		 561 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 1190 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 1064 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  28.16 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.7 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  23.83 
 
 		 1108 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  26.77 
 
 		 1082 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  31.23 
 
 		 597 aa  69.3  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  27.8 
 
 		 1094 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  27.73 
 
 		 1097 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  27.8 
 
 		 1083 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.67 
 
 		 1109 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  29.59 
 
 		 1044 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  29.48 
 
 		 1018 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  28.99 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  28.19 
 
 		 621 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  28.63 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  30.83 
 
 		 1119 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  30.3 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  26.8 
 
 		 999 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  26.17 
 
 		 954 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  28.38 
 
 		 1061 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 654 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.17 
 
 		 919 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  26.56 
 
 		 1095 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 1116 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  28.24 
 
 		 991 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  27.97 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  25.28 
 
 		 1126 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.19 
 
 		 1067 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 968 aa  59.3  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.36 
 
 		 1118 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.36 
 
 		 1118 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  28.97 
 
 		 1102 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  27.42 
 
 		 1025 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  27.8 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  28.17 
 
 		 1008 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  25.91 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  26.62 
 
 		 1014 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  28.42 
 
 		 668 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  27.75 
 
 		 934 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  24.38 
 
 		 370 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  31.03 
 
 		 1071 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  27.08 
 
 		 1003 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  28.16 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  27.24 
 
 		 1020 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 647 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  26.87 
 
 		 1064 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.53 
 
 		 1075 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 636 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0014  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.44 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  25.1 
 
 		 965 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 1050 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 212 aa  52.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.5 
 
 		 631 aa  52.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  27.06 
 
 		 941 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2887  transcriptional regulator domain protein  36.24 
 
 		 997 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0904649  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 1151 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  27.18 
 
 		 1121 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  25.11 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  26.69 
 
 		 1013 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  30.4 
 
 		 1123 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 760 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  24.72 
 
 		 1010 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  26.24 
 
 		 981 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  30.72 
 
 		 881 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  25.1 
 
 		 921 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  27.39 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  31.16 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  26.67 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  29.57 
 
 		 833 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  26.7 
 
 		 971 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  27.1 
 
 		 1058 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.35 
 
 		 496 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  30.6 
 
 		 957 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  27.85 
 
 		 428 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.76 
 
 		 1123 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 		 379 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  31.3 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  29.88 
 
 		 990 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  30.17 
 
 		 1009 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 1043 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0476  transcriptional regulator, SARP family  29.92 
 
 		 639 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  17.8 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  27.5 
 
 		 940 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8592  response regulator receiver and SARP domain protein  23.67 
 
 		 575 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169178  normal  0.403545 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>