97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2691 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  527  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  87.07 
 
 		 275 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  48.07 
 
 		 261 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  47.48 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  46.9 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  43.42 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  40.27 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  42.24 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 494 aa  89.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  31.68 
 
 		 1067 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  34.55 
 
 		 1139 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  33.03 
 
 		 1029 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  28.46 
 
 		 1097 aa  65.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  33.64 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.29 
 
 		 1075 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 1217 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 1064 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.94 
 
 		 1126 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.21 
 
 		 999 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  29.1 
 
 		 1083 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  32.31 
 
 		 1055 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.82 
 
 		 1339 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  31.77 
 
 		 713 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 1050 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 1216 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  30.84 
 
 		 689 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 636 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 1116 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 1190 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.26 
 
 		 1056 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  32.52 
 
 		 1163 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.05 
 
 		 965 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  24.34 
 
 		 1034 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.47 
 
 		 1013 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  28.77 
 
 		 1145 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  30.28 
 
 		 1143 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 1089 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.49 
 
 		 1111 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  30.71 
 
 		 597 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.65 
 
 		 561 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.67 
 
 		 1109 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  27.02 
 
 		 1204 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 1193 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.28 
 
 		 572 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.8 
 
 		 907 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  30.77 
 
 		 1118 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 775 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 526 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  28.04 
 
 		 549 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 453 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  28.95 
 
 		 992 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 647 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 621 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  26.17 
 
 		 1163 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 1088 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.91 
 
 		 914 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  31.68 
 
 		 1044 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 489 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 648 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  29.26 
 
 		 985 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  24.24 
 
 		 981 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  29.82 
 
 		 1003 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  35.98 
 
 		 647 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  31.8 
 
 		 1118 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  31.79 
 
 		 1083 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3418  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 973 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  25.69 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  34.65 
 
 		 1119 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  31.8 
 
 		 1118 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  27.56 
 
 		 1010 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 786 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  30.14 
 
 		 661 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 343 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  25 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  32.91 
 
 		 1123 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 423 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  29.7 
 
 		 1014 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  28.4 
 
 		 650 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  26.36 
 
 		 631 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  29.64 
 
 		 1183 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27.98 
 
 		 1108 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  30.99 
 
 		 1009 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  32.49 
 
 		 1018 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  29.91 
 
 		 990 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  30.52 
 
 		 881 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  30.47 
 
 		 921 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  30.97 
 
 		 963 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 644 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  27.55 
 
 		 621 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  27.24 
 
 		 990 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  29.85 
 
 		 655 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1206  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1142 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2213  SARP family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 612 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226859  normal  0.3766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  28.11 
 
 		 378 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  24.27 
 
 		 1145 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>