99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2507 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  87.07 
 
 		 271 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  47.83 
 
 		 261 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  48.58 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  46.55 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  40.6 
 
 		 248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  42.73 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  41.38 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  31.23 
 
 		 494 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  31.4 
 
 		 1067 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  33.16 
 
 		 1139 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  30.47 
 
 		 1126 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  28.63 
 
 		 1083 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.8 
 
 		 1029 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.7 
 
 		 1075 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  33.46 
 
 		 1143 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.04 
 
 		 999 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 1217 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  25.22 
 
 		 1034 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  29.46 
 
 		 713 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  26.91 
 
 		 1097 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 1050 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 1216 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 1064 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.91 
 
 		 1055 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 636 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 1116 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  32.11 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 648 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.96 
 
 		 1109 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 621 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.92 
 
 		 1013 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  26.82 
 
 		 1145 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 1089 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.44 
 
 		 914 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28 
 
 		 907 aa  54.7  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.54 
 
 		 1339 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  26.2 
 
 		 1204 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  35 
 
 		 647 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  29.56 
 
 		 1014 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.22 
 
 		 1056 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  21.43 
 
 		 1111 aa  52.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  29.06 
 
 		 965 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  33.18 
 
 		 1123 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  29.58 
 
 		 597 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  29.77 
 
 		 689 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 		 647 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.6 
 
 		 1088 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  31.11 
 
 		 1163 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 489 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  28.44 
 
 		 621 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  27.64 
 
 		 549 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  26.1 
 
 		 981 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1206  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1142 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 1193 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  24.89 
 
 		 561 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  30.69 
 
 		 1044 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 773 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 760 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  27.94 
 
 		 990 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  28.11 
 
 		 1003 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  29.96 
 
 		 1183 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.67 
 
 		 572 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  25.4 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 775 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  29.27 
 
 		 1018 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 453 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  26.16 
 
 		 1010 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  29.89 
 
 		 992 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 1190 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  31.87 
 
 		 644 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  29.39 
 
 		 1097 aa  45.4  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 1145 aa  45.4  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  30.41 
 
 		 526 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  24.34 
 
 		 1163 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  27.9 
 
 		 631 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.82 
 
 		 1118 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  27.27 
 
 		 1054 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.82 
 
 		 1118 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 786 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27.53 
 
 		 1108 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  26.29 
 
 		 985 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  24.79 
 
 		 867 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3418  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 973 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  20.35 
 
 		 343 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  25.98 
 
 		 1094 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  24.8 
 
 		 1095 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  29.58 
 
 		 1058 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  26.05 
 
 		 1093 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 644 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 644 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1552  SARP family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  0.0981278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.36 
 
 		 950 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 952 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  29.65 
 
 		 1009 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  36.73 
 
 		 1110 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>