50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1299 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  99.53 
 
 		 644 aa  1272    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  86.84 
 
 		 644 aa  1106    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1277    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  44.02 
 
 		 623 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0870  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 679 aa  222  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.918273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1578  SARP family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 530 aa  137  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.584481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7646  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 529 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.158995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3528  SARP family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 539 aa  123  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  24.41 
 
 		 607 aa  97.1  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 584 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  26.72 
 
 		 594 aa  88.2  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 597 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  28.51 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3925  SARP family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 528 aa  75.5  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0539  hypothetical protein  30.46 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0538  SARP family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 266 aa  73.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 202 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  29.3 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  28.42 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  24.72 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  30.2 
 
 		 531 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 647 aa  55.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 636 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  30.21 
 
 		 527 aa  53.5  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.97 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  22.67 
 
 		 603 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.24 
 
 		 596 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  24.32 
 
 		 641 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  30.43 
 
 		 1126 aa  50.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 1064 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  27.32 
 
 		 499 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  35.87 
 
 		 1075 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.32 
 
 		 598 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1418  hypothetical protein  26.94 
 
 		 643 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.070904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  29.51 
 
 		 525 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  23.84 
 
 		 584 aa  47.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  31.87 
 
 		 275 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  26.73 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  29.28 
 
 		 1163 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 773 aa  45.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  32.35 
 
 		 1056 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 518 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 343 aa  44.3  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  32.91 
 
 		 1044 aa  44.3  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.16 
 
 		 631 aa  43.9  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  28.12 
 
 		 605 aa  44.3  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 922 aa  43.9  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>