22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1578 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1578  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 530 aa  1083    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.584481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7646  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 529 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.158995  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 644 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  25.39 
 
 		 644 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3925  SARP family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 528 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3528  SARP family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 539 aa  120  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0870  transcriptional regulator  28.2 
 
 		 679 aa  116  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.918273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 584 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  38.62 
 
 		 623 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 580 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.86 
 
 		 631 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 202 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 584 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  29.84 
 
 		 619 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 647 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 575 aa  47  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  26.36 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 556 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  27.92 
 
 		 525 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  28.21 
 
 		 574 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>