168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3797 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 584 aa  1174    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 		 582 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 580 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  25.79 
 
 		 522 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  25.95 
 
 		 525 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  25.63 
 
 		 531 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 644 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 644 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  40.94 
 
 		 644 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0538  SARP family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.73 
 
 		 596 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  26.77 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  23.17 
 
 		 623 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 626 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3528  SARP family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.45 
 
 		 631 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 636 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  25.71 
 
 		 543 aa  72  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  25.06 
 
 		 510 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  25.75 
 
 		 521 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  25.12 
 
 		 518 aa  67  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.27 
 
 		 643 aa  67.4  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.24 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  25.89 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.39 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 878 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.43 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 647 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7646  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.158995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  22.96 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.08 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.7 
 
 		 736 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.75 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.76 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  22.91 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.83 
 
 		 632 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.31 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1578  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.584481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 597 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  30.83 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  23.59 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3925  SARP family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.25 
 
 		 648 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.71 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  23.56 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.85 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  24.21 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  22.06 
 
 		 652 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0870  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 679 aa  55.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.918273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.33 
 
 		 689 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  20.81 
 
 		 606 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 615 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  23.24 
 
 		 527 aa  54.3  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  33.54 
 
 		 549 aa  53.9  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  24.24 
 
 		 508 aa  53.9  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  27.14 
 
 		 573 aa  53.5  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  23.86 
 
 		 647 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  22.6 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.92 
 
 		 746 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 3560 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  23.57 
 
 		 502 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 376 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.72 
 
 		 626 aa  52  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.21 
 
 		 267 aa  51.2  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.65 
 
 		 1022 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 612 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  35.66 
 
 		 911 aa  50.8  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 1421 aa  50.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  20.55 
 
 		 603 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 636 aa  50.4  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.31 
 
 		 758 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 626 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 394 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 313 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 3035 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 614 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 614 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.24 
 
 		 750 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 620 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 614 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  24.88 
 
 		 603 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.76 
 
 		 664 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.87 
 
 		 620 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  24.35 
 
 		 581 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 206 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 		 543 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 291 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 		 261 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0116  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 207 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 260 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 265 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 944 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 357 aa  48.5  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 416 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 357 aa  47.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 265 aa  48.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 207 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>