More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0927 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
291 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  68.53 
 
 
297 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  68.53 
 
 
297 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.85 
 
 
291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  53.26 
 
 
297 aa  298  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  51.09 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  48.79 
 
 
288 aa  277  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  46.82 
 
 
287 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.91 
 
 
1694 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
288 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  31.76 
 
 
287 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  29.78 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  27.27 
 
 
297 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0006  hypothetical protein  32.38 
 
 
293 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  28.27 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.668643  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  32.83 
 
 
297 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  27.84 
 
 
287 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
878 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.85 
 
 
810 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
718 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
3145 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
543 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
270 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
270 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
615 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.46 
 
 
632 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
620 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.41 
 
 
733 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.33 
 
 
620 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
927 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.65 
 
 
1056 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.39 
 
 
784 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.74 
 
 
626 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.93 
 
 
818 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.26 
 
 
436 aa  79.3  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.17 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
750 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.44 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.82 
 
 
1056 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25 
 
 
725 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
505 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
639 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
612 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.39 
 
 
626 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  29.56 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.39 
 
 
614 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.39 
 
 
614 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
614 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
670 aa  76.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
635 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
636 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.39 
 
 
626 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
614 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
635 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.35 
 
 
681 aa  75.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
614 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
649 aa  75.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
637 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.4 
 
 
739 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 
689 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.59 
 
 
661 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
611 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.2 
 
 
1154 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.07 
 
 
875 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  28.65 
 
 
535 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
4079 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
847 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 
3560 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.91 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
597 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.67 
 
 
742 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 
3035 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.22 
 
 
988 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  24.47 
 
 
560 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
523 aa  73.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 
2240 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.9 
 
 
622 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  26.95 
 
 
750 aa  72.8  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.14 
 
 
1676 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
573 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  28.47 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
1252 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.44 
 
 
1022 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
565 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
715 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>