23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0538 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0538  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 584 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 582 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 644 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  32.59 
 
 		 644 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 644 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3528  SARP family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 539 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  31.58 
 
 		 911 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  35.64 
 
 		 607 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  35.06 
 
 		 594 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0870  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 679 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.918273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  32.67 
 
 		 623 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7646  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 529 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.158995  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  30.33 
 
 		 549 aa  45.4  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0330  SARP family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.761582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  27.03 
 
 		 943 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 644 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  29.11 
 
 		 686 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  27.7 
 
 		 1289 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1578  SARP family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 530 aa  42  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.584481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>