30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0870 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0870  transcriptional regulator  100 
 
 		 679 aa  1405    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.918273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 644 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 644 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  30.62 
 
 		 644 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1578  SARP family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 530 aa  125  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.584481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3528  SARP family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 539 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7646  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 529 aa  91.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.158995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 584 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3925  SARP family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 528 aa  73.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 580 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  22.61 
 
 		 594 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0538  SARP family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 266 aa  57  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  25.11 
 
 		 404 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 597 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 584 aa  54.3  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.29 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  22.26 
 
 		 607 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  30.87 
 
 		 911 aa  47  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 641 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  26.24 
 
 		 531 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  28.3 
 
 		 275 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 271 aa  44.3  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 647 aa  44.3  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  31.58 
 
 		 375 aa  44.3  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 343 aa  44.3  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.37 
 
 		 1075 aa  43.9  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 647 aa  43.9  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>