73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1835 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 343 aa  688    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  29 
 
 		 349 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  26.69 
 
 		 1111 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  23.81 
 
 		 561 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  29.41 
 
 		 1204 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  23.2 
 
 		 572 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1812  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.37 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 1193 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  26.43 
 
 		 1163 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 775 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  30.36 
 
 		 1145 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.17 
 
 		 999 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  28.89 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  34.44 
 
 		 1075 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  25.41 
 
 		 597 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  24.89 
 
 		 661 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  28.74 
 
 		 1119 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 1116 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  25.9 
 
 		 1109 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 1190 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  28.66 
 
 		 689 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  28.48 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  27.89 
 
 		 1082 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  24.36 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  26.38 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 1064 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  25 
 
 		 1118 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  25 
 
 		 1118 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  23.49 
 
 		 1097 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27.56 
 
 		 1108 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  22.22 
 
 		 1126 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  26.01 
 
 		 1061 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  31.21 
 
 		 1055 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  26.56 
 
 		 365 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0864  SARP family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.614724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  25.88 
 
 		 1095 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  24.73 
 
 		 1083 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  21.94 
 
 		 1071 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  27.42 
 
 		 268 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 212 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  25.88 
 
 		 1094 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1568  response regulator receiver and SARP domain protein  35.62 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0553389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  26.37 
 
 		 215 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  30.99 
 
 		 1000 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  24.58 
 
 		 376 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  22.22 
 
 		 925 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  38.89 
 
 		 1055 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 636 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  22.52 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  24.54 
 
 		 1029 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  27.04 
 
 		 376 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  23.04 
 
 		 428 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  21.03 
 
 		 907 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0497  response regulator receiver and SARP domain protein  29.17 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000475999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  27.97 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  25.64 
 
 		 1044 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 271 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 644 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  24.79 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  23.93 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 644 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  31.63 
 
 		 644 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  20.35 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.58 
 
 		 1013 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0817  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 		 117 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.686182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4304  response regulator receiver and SARP domain protein  25.53 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>