88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0233 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 911 aa  1758    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  26.61 
 
 		 1163 aa  95.5  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.82 
 
 		 1067 aa  95.5  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  26.59 
 
 		 1013 aa  75.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.11 
 
 		 1055 aa  74.3  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  31.18 
 
 		 549 aa  73.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  27 
 
 		 1139 aa  72.4  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  26.55 
 
 		 999 aa  71.6  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.01 
 
 		 1075 aa  69.7  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.43 
 
 		 1034 aa  68.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  24.88 
 
 		 1126 aa  67  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  25.66 
 
 		 1029 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  31.25 
 
 		 916 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 1064 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  25.93 
 
 		 1071 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  28.25 
 
 		 1114 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.42 
 
 		 998 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  25.89 
 
 		 1132 aa  60.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  27.81 
 
 		 1092 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  27.27 
 
 		 1044 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  22 
 
 		 713 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 1050 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  28.64 
 
 		 650 aa  60.1  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  24.36 
 
 		 1141 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.3 
 
 		 1006 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  25.98 
 
 		 999 aa  58.9  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  27.96 
 
 		 1017 aa  58.9  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  22.89 
 
 		 1183 aa  58.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 1216 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  28.46 
 
 		 963 aa  57.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 1022 aa  57.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  28.96 
 
 		 641 aa  57.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 1118 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  28.57 
 
 		 1809 aa  57  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.4 
 
 		 1111 aa  56.2  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  25.43 
 
 		 494 aa  55.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  24.84 
 
 		 1058 aa  55.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  25.08 
 
 		 1005 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.35 
 
 		 957 aa  54.7  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  27.16 
 
 		 1143 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.79 
 
 		 1103 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  26.4 
 
 		 597 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1401  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 		 1333 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0538  SARP family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  53.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  25.76 
 
 		 1871 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 1161 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  25 
 
 		 1109 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  25.06 
 
 		 1148 aa  52  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  28.61 
 
 		 965 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  27.7 
 
 		 919 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 		 983 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.36 
 
 		 1845 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  27.59 
 
 		 957 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  24.32 
 
 		 1833 aa  50.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 		 1096 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.42 
 
 		 992 aa  49.3  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  29.14 
 
 		 1289 aa  48.9  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 973 aa  49.3  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  30.03 
 
 		 937 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 647 aa  48.9  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 1116 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.2 
 
 		 900 aa  48.9  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  25.45 
 
 		 1733 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 881 aa  48.9  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  24.62 
 
 		 1836 aa  48.5  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  28.76 
 
 		 1055 aa  48.5  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  25.55 
 
 		 631 aa  48.5  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 994 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 580 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 516 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  28.78 
 
 		 1007 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.16 
 
 		 954 aa  47  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  27.76 
 
 		 1158 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.33 
 
 		 1441 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  26.32 
 
 		 1027 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 644 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 584 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22 
 
 		 1175 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 		 1403 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  26.76 
 
 		 1123 aa  45.8  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  23.26 
 
 		 1048 aa  45.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 723 aa  44.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  25.06 
 
 		 953 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 1141 aa  44.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  25.16 
 
 		 1018 aa  44.3  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 644 aa  44.3  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  25.87 
 
 		 1029 aa  44.3  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  31.29 
 
 		 1064 aa  44.3  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>