More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3733 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 1007 aa  1966    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 965 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 975 aa  571  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 954 aa  126  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  32.93 
 
 		 1006 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.84 
 
 		 1148 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.45 
 
 		 1149 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  32.26 
 
 		 916 aa  112  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.84 
 
 		 1141 aa  111  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 1084 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 		 1138 aa  109  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.16 
 
 		 1227 aa  105  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.3 
 
 		 983 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  27.92 
 
 		 993 aa  104  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.16 
 
 		 1175 aa  101  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.02 
 
 		 992 aa  101  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 		 1398 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 		 1050 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.35 
 
 		 1050 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.03 
 
 		 1360 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.29 
 
 		 1053 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.64 
 
 		 1055 aa  99.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.72 
 
 		 1029 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  27.2 
 
 		 1093 aa  98.2  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 1139 aa  97.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  32.82 
 
 		 957 aa  97.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 		 967 aa  97.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.97 
 
 		 1151 aa  97.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.67 
 
 		 1403 aa  96.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  30.42 
 
 		 1013 aa  95.9  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30 
 
 		 1118 aa  96.3  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 		 1022 aa  95.1  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 		 982 aa  94.7  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.25 
 
 		 1402 aa  94.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1401  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 		 1333 aa  94.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.95 
 
 		 1151 aa  94  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.8 
 
 		 1014 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  30.91 
 
 		 964 aa  94  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  27.93 
 
 		 959 aa  94  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 966 aa  93.2  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.06 
 
 		 1160 aa  93.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  29.66 
 
 		 970 aa  92.8  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.25 
 
 		 1094 aa  91.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26.57 
 
 		 1122 aa  91.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.22 
 
 		 1183 aa  91.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 973 aa  91.3  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 		 900 aa  91.3  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 		 1105 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  32.03 
 
 		 963 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 723 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.73 
 
 		 1885 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  25.39 
 
 		 1048 aa  89.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.08 
 
 		 1034 aa  89  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 1744 aa  89.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.25 
 
 		 1080 aa  88.6  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.27 
 
 		 1134 aa  88.6  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  31.41 
 
 		 1132 aa  88.2  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.34 
 
 		 1117 aa  88.2  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  27.49 
 
 		 1139 aa  88.2  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.6 
 
 		 1089 aa  87.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.86 
 
 		 967 aa  87.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.84 
 
 		 1123 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.95 
 
 		 1422 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 1005 aa  86.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 1403 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.28 
 
 		 1685 aa  85.1  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.23 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.17 
 
 		 1146 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 		 1142 aa  82.4  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.59 
 
 		 1046 aa  81.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.75 
 
 		 1081 aa  81.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.75 
 
 		 1429 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  25.67 
 
 		 1055 aa  80.9  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  29.58 
 
 		 1143 aa  80.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.95 
 
 		 1295 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.29 
 
 		 1264 aa  80.1  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  24.06 
 
 		 1774 aa  79.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.91 
 
 		 1291 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.18 
 
 		 1055 aa  78.2  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  20.05 
 
 		 1805 aa  77.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 952 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 		 1063 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  25.46 
 
 		 1739 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 952 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.04 
 
 		 1067 aa  77  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  20.05 
 
 		 1932 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  29.96 
 
 		 937 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  27.66 
 
 		 1685 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  24.09 
 
 		 1644 aa  75.5  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  24.53 
 
 		 1908 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 1013 aa  74.7  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  23.12 
 
 		 2272 aa  74.7  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  24.75 
 
 		 1169 aa  74.7  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 864 aa  74.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 1151 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.4 
 
 		 1441 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  28.5 
 
 		 963 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  29.53 
 
 		 953 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 1116 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  25.9 
 
 		 1833 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>