More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4896 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  53.4 
 
 		 963 aa  796    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  62.15 
 
 		 963 aa  994    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  100 
 
 		 957 aa  1831    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  36.49 
 
 		 937 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  35.13 
 
 		 973 aa  323  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  35.25 
 
 		 952 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.76 
 
 		 1029 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  32.39 
 
 		 1123 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 966 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  31.92 
 
 		 916 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.45 
 
 		 1291 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 973 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  31.66 
 
 		 1007 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 900 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 967 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 		 1005 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.92 
 
 		 1006 aa  101  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  30.07 
 
 		 1034 aa  101  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.78 
 
 		 1160 aa  98.2  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 992 aa  96.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 981 aa  95.5  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  29.72 
 
 		 959 aa  95.1  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.45 
 
 		 1080 aa  95.1  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  34.7 
 
 		 953 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  31.19 
 
 		 1788 aa  93.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  27.01 
 
 		 1682 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.67 
 
 		 1055 aa  92  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.63 
 
 		 1105 aa  92  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 881 aa  92  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.46 
 
 		 1067 aa  90.5  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 975 aa  90.5  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  28.12 
 
 		 1685 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.58 
 
 		 983 aa  90.5  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 970 aa  90.1  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  27.2 
 
 		 1682 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  29.84 
 
 		 982 aa  89.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  24.79 
 
 		 1134 aa  89.4  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  32.82 
 
 		 1101 aa  89.7  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.48 
 
 		 1150 aa  89.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 965 aa  89  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 895 aa  89  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  29.27 
 
 		 1121 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  31.7 
 
 		 1163 aa  88.2  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 872 aa  88.2  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  31.31 
 
 		 1885 aa  87.8  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  27.4 
 
 		 1123 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.57 
 
 		 1081 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 1216 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.96 
 
 		 1089 aa  87  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 1193 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 		 1235 aa  86.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 1161 aa  85.1  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.47 
 
 		 1075 aa  85.1  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 1089 aa  84.7  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  30.32 
 
 		 1685 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.37 
 
 		 1122 aa  84.7  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  28.87 
 
 		 1133 aa  84.7  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.03 
 
 		 1055 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.27 
 
 		 1403 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 		 1036 aa  83.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 		 1050 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.5 
 
 		 1050 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  24.43 
 
 		 1148 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  28.54 
 
 		 1744 aa  82.4  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  27.3 
 
 		 1020 aa  82  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 1015 aa  82  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 		 1403 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  29.63 
 
 		 1685 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.53 
 
 		 1149 aa  81.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.17 
 
 		 1022 aa  80.9  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  37.55 
 
 		 937 aa  80.9  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 967 aa  80.9  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.69 
 
 		 1871 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 866 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.93 
 
 		 1666 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 999 aa  78.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 		 1644 aa  78.2  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 927 aa  78.2  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  28.06 
 
 		 1084 aa  77.8  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  23.99 
 
 		 1850 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.29 
 
 		 1175 aa  77.4  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  21.22 
 
 		 1826 aa  77.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 1190 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.05 
 
 		 2017 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  33.43 
 
 		 1118 aa  75.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  33.2 
 
 		 1090 aa  75.5  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.68 
 
 		 1780 aa  75.1  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  24.3 
 
 		 2303 aa  74.7  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  32.16 
 
 		 1153 aa  74.7  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  26.24 
 
 		 1836 aa  74.7  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  27.21 
 
 		 864 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.36 
 
 		 1822 aa  74.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  33.51 
 
 		 964 aa  74.3  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.16 
 
 		 1804 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  24.61 
 
 		 2272 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  41.51 
 
 		 917 aa  73.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.79 
 
 		 713 aa  72.8  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 		 1311 aa  72.8  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.8 
 
 		 1295 aa  72.4  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  27.72 
 
 		 993 aa  72.4  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>