More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0773 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 967 aa  1908    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  63.93 
 
 		 973 aa  1103    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  48.25 
 
 		 954 aa  695    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 		 959 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  35.76 
 
 		 900 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  35.67 
 
 		 999 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  34.14 
 
 		 992 aa  363  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  36.66 
 
 		 1013 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 1084 aa  349  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  37.55 
 
 		 981 aa  309  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  40.92 
 
 		 983 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  33.37 
 
 		 953 aa  257  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  35.2 
 
 		 916 aa  254  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 982 aa  244  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 1005 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  33.87 
 
 		 1006 aa  232  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 970 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 993 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  30.19 
 
 		 964 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 967 aa  207  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  33.39 
 
 		 937 aa  158  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 1022 aa  146  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  26.39 
 
 		 1020 aa  129  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.5 
 
 		 1029 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 1015 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  31.07 
 
 		 1054 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 895 aa  119  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  32.93 
 
 		 1029 aa  118  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  29.47 
 
 		 713 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.62 
 
 		 1175 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 		 1105 aa  115  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  33.42 
 
 		 1075 aa  114  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  32.05 
 
 		 1121 aa  114  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.27 
 
 		 1067 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26.11 
 
 		 1122 aa  111  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 1118 aa  111  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  31.21 
 
 		 1123 aa  111  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.24 
 
 		 1227 aa  110  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  32.1 
 
 		 1055 aa  110  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.12 
 
 		 1126 aa  109  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.23 
 
 		 1150 aa  108  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  30.18 
 
 		 977 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.57 
 
 		 1034 aa  108  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  22.69 
 
 		 1147 aa  106  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  29.14 
 
 		 1051 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 		 1403 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  27.78 
 
 		 1134 aa  104  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 966 aa  104  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  29.71 
 
 		 1071 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  32.64 
 
 		 937 aa  104  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 1141 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 1141 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.47 
 
 		 1422 aa  102  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 		 998 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  28.47 
 
 		 965 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 		 956 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  27.76 
 
 		 864 aa  99.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.94 
 
 		 1429 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.05 
 
 		 1081 aa  99.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.17 
 
 		 2279 aa  100  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.82 
 
 		 1080 aa  100  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.91 
 
 		 1291 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 1141 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 1190 aa  98.2  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 1193 aa  98.2  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.09 
 
 		 1109 aa  98.2  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  27.42 
 
 		 872 aa  96.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.58 
 
 		 2303 aa  96.7  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.87 
 
 		 1271 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 1116 aa  96.3  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 		 1348 aa  96.3  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 		 1311 aa  95.9  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.01 
 
 		 1050 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.01 
 
 		 1050 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  26.17 
 
 		 1132 aa  95.1  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27 
 
 		 1055 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.05 
 
 		 1141 aa  94  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  25.31 
 
 		 1377 aa  94  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  29.93 
 
 		 1183 aa  94  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 		 1349 aa  94  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.14 
 
 		 1037 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 		 1398 aa  93.6  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  27.05 
 
 		 1043 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 975 aa  92.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 1349 aa  91.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 1349 aa  91.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.45 
 
 		 1780 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 952 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 952 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 		 1160 aa  91.3  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 928 aa  90.5  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  30.23 
 
 		 1123 aa  90.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.23 
 
 		 1666 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 		 1383 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 		 1342 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.64 
 
 		 1094 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 973 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 927 aa  89.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  27.94 
 
 		 1065 aa  89.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.38 
 
 		 1118 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>