More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2931 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  49.81 
 
 
1029 aa  833    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  100 
 
 
1051 aa  2063    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  49.34 
 
 
1054 aa  848    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  32.85 
 
 
1123 aa  170  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  30.4 
 
 
1114 aa  164  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  31.47 
 
 
1022 aa  163  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  32.86 
 
 
1123 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 
982 aa  142  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.57 
 
 
1118 aa  142  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  28.72 
 
 
1132 aa  141  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  32.15 
 
 
1121 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 
900 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 
983 aa  134  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.71 
 
 
1150 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  32.34 
 
 
954 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.06 
 
 
1029 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.08 
 
 
1071 aa  127  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 
981 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
973 aa  127  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.31 
 
 
1141 aa  127  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.49 
 
 
1006 aa  126  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  27.98 
 
 
1118 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29.77 
 
 
1015 aa  122  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.65 
 
 
1227 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.48 
 
 
916 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  30.32 
 
 
970 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.76 
 
 
1055 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 
992 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.69 
 
 
967 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 
1153 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.79 
 
 
1141 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  29.79 
 
 
1141 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  29.79 
 
 
1141 aa  109  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.1 
 
 
1080 aa  107  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  31.45 
 
 
1013 aa  106  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.77 
 
 
1005 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.09 
 
 
1148 aa  105  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  29.53 
 
 
1198 aa  105  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  28.69 
 
 
932 aa  105  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.66 
 
 
966 aa  104  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.5 
 
 
1067 aa  104  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.24 
 
 
1161 aa  104  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  24.5 
 
 
1105 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  25.91 
 
 
993 aa  101  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  26.33 
 
 
723 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
881 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  29.31 
 
 
967 aa  100  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.16 
 
 
1139 aa  98.2  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.76 
 
 
1797 aa  97.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29 
 
 
1151 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  24.61 
 
 
1020 aa  97.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.91 
 
 
1151 aa  96.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  28.19 
 
 
1922 aa  96.3  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  31.42 
 
 
938 aa  95.9  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.71 
 
 
1117 aa  95.1  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  29.57 
 
 
1090 aa  94.7  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.14 
 
 
1780 aa  94.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  28.34 
 
 
999 aa  92.8  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  28.65 
 
 
959 aa  92.8  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1555  hypothetical protein  37.57 
 
 
566 aa  92.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  28.99 
 
 
1036 aa  92  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6477  LuxR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
603 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217182  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.31 
 
 
1134 aa  91.7  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 
1138 aa  90.1  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.1 
 
 
1089 aa  89.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.43 
 
 
1109 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.24 
 
 
1795 aa  89  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  24.45 
 
 
1908 aa  89  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26.21 
 
 
1122 aa  88.6  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 
1063 aa  88.2  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.52 
 
 
1804 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.63 
 
 
1081 aa  87.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  35.58 
 
 
1053 aa  87.4  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.74 
 
 
1055 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.51 
 
 
1094 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  24.42 
 
 
2272 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  28.25 
 
 
867 aa  85.5  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  28.91 
 
 
1141 aa  85.5  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  26.4 
 
 
1885 aa  85.5  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0735  hypothetical protein  51.65 
 
 
112 aa  85.1  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0480212  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.38 
 
 
2017 aa  84.7  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  25.66 
 
 
1123 aa  84.7  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  32.07 
 
 
1809 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  24.69 
 
 
1183 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 
1914 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
895 aa  83.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  31.41 
 
 
1811 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  22.82 
 
 
1271 aa  84  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  27.09 
 
 
1148 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  28.16 
 
 
1833 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
1942 aa  82.8  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  28.53 
 
 
977 aa  82.8  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.3 
 
 
1075 aa  82.4  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.87 
 
 
1712 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.45 
 
 
1403 aa  81.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  27.43 
 
 
864 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  25.82 
 
 
1050 aa  81.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.82 
 
 
1050 aa  81.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  26.15 
 
 
1682 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.27 
 
 
1149 aa  80.1  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>