More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0361 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  63.82 
 
 		 967 aa  1133    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  48.42 
 
 		 954 aa  690    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 973 aa  1894    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  38.56 
 
 		 900 aa  439  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  34.97 
 
 		 959 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 1084 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 999 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  37.4 
 
 		 1013 aa  364  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  34.05 
 
 		 1006 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 992 aa  304  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 981 aa  303  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  36.83 
 
 		 983 aa  278  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 982 aa  249  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  35.35 
 
 		 916 aa  240  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 1005 aa  233  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 		 993 aa  222  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  31.36 
 
 		 964 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 970 aa  208  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 		 967 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  37.87 
 
 		 953 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 937 aa  148  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  33.25 
 
 		 1022 aa  143  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.45 
 
 		 1105 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  27.29 
 
 		 1020 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 895 aa  133  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  31.19 
 
 		 1034 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  33.56 
 
 		 1123 aa  127  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.93 
 
 		 1150 aa  124  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.67 
 
 		 1227 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  32.78 
 
 		 1121 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  32.69 
 
 		 1054 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.21 
 
 		 1175 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  31.36 
 
 		 1051 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 1015 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 1118 aa  118  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  32.29 
 
 		 1123 aa  118  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  30.12 
 
 		 977 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.33 
 
 		 1029 aa  115  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.23 
 
 		 1295 aa  115  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 1116 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.67 
 
 		 1029 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.72 
 
 		 998 aa  112  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  28.66 
 
 		 872 aa  112  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.23 
 
 		 1141 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.78 
 
 		 1160 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  34.55 
 
 		 937 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.7 
 
 		 713 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.2 
 
 		 1291 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  28.45 
 
 		 866 aa  108  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 		 1403 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 965 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.51 
 
 		 1080 aa  105  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  30.39 
 
 		 1118 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.72 
 
 		 1122 aa  105  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  31.01 
 
 		 966 aa  105  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  32.16 
 
 		 1109 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30.39 
 
 		 1118 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 975 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.54 
 
 		 1081 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 956 aa  101  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.69 
 
 		 1422 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.37 
 
 		 1037 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  22.84 
 
 		 2279 aa  99.4  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.43 
 
 		 1071 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 		 1271 aa  99  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  24.56 
 
 		 1134 aa  98.2  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.81 
 
 		 1403 aa  97.8  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  27.03 
 
 		 1377 aa  97.8  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  26.19 
 
 		 900 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  28.22 
 
 		 1083 aa  97.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  27.96 
 
 		 1114 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.92 
 
 		 1126 aa  96.3  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 1198 aa  95.9  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  23.52 
 
 		 1712 aa  95.5  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  27.63 
 
 		 1132 aa  95.5  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  30.3 
 
 		 957 aa  95.1  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.97 
 
 		 1055 aa  94.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  28.82 
 
 		 864 aa  94.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.93 
 
 		 1067 aa  93.6  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.65 
 
 		 1093 aa  93.6  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28 
 
 		 1141 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28 
 
 		 1141 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 1190 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 1398 aa  93.6  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 1193 aa  92.8  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.75 
 
 		 1429 aa  92.8  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 881 aa  92.8  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 1402 aa  92.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0515  ATPase-like  26.91 
 
 		 1079 aa  92.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.16 
 
 		 1138 aa  92  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.63 
 
 		 1075 aa  92  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.91 
 
 		 1055 aa  92  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  26.67 
 
 		 1809 aa  92  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  22.98 
 
 		 2303 aa  92  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.46 
 
 		 1441 aa  91.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 1349 aa  91.3  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 1007 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 1342 aa  91.3  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  30.85 
 
 		 932 aa  90.9  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 1348 aa  90.9  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>