More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5916 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 864 aa  1725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 895 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 881 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  36.34 
 
 		 872 aa  360  7e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 866 aa  311  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  32.84 
 
 		 862 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  31.26 
 
 		 867 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  31.95 
 
 		 872 aa  267  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  25.99 
 
 		 900 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 954 aa  111  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.76 
 
 		 967 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.95 
 
 		 1006 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  25.99 
 
 		 1005 aa  98.6  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 983 aa  97.8  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 973 aa  94.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.37 
 
 		 992 aa  92.8  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  25.77 
 
 		 959 aa  89.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.82 
 
 		 1089 aa  88.6  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.01 
 
 		 1071 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.95 
 
 		 1123 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  25.18 
 
 		 982 aa  82.4  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  28.09 
 
 		 967 aa  82  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.24 
 
 		 1160 aa  81.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 		 981 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 		 1084 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 1141 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 1141 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  25.86 
 
 		 1141 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 1148 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25 
 
 		 1020 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  27.36 
 
 		 1013 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  27.43 
 
 		 1051 aa  78.6  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 1198 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.57 
 
 		 713 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  29.16 
 
 		 1123 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 1141 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 1015 aa  75.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.56 
 
 		 1080 aa  76.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  24.55 
 
 		 993 aa  75.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 		 1311 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 975 aa  75.1  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 1007 aa  74.3  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  26.32 
 
 		 937 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  26.76 
 
 		 964 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  25.42 
 
 		 1034 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  29.56 
 
 		 953 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  27.71 
 
 		 999 aa  72  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  24.57 
 
 		 1114 aa  71.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  25.05 
 
 		 1402 aa  71.2  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  25.93 
 
 		 965 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  25.54 
 
 		 970 aa  70.1  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.25 
 
 		 1291 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  29.43 
 
 		 937 aa  69.3  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  27.65 
 
 		 940 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  25.75 
 
 		 1054 aa  68.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  43.56 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  25.65 
 
 		 1022 aa  68.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 1116 aa  67.8  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  35.26 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 214 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 207 aa  67  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  27.46 
 
 		 927 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 222 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 223 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  27.71 
 
 		 1053 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  22.84 
 
 		 1148 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.6 
 
 		 210 aa  67  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1688  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 385 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 1089 aa  66.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.02 
 
 		 1666 aa  65.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.41 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  26.71 
 
 		 1139 aa  65.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  31.98 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.3 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  28.54 
 
 		 963 aa  65.1  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.53 
 
 		 1067 aa  65.1  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  28.03 
 
 		 1118 aa  64.7  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  20.25 
 
 		 1147 aa  64.3  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 781 aa  64.3  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.23 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  28.97 
 
 		 925 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 237 aa  63.9  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  25.49 
 
 		 1029 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 237 aa  63.9  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.08 
 
 		 1081 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 928 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  27.05 
 
 		 957 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.19 
 
 		 1141 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 574 aa  63.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.35 
 
 		 219 aa  63.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 1320 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 219 aa  62.4  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  27.54 
 
 		 943 aa  62.4  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  24.2 
 
 		 1885 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  25.83 
 
 		 1075 aa  62.4  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 544 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 544 aa  62  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>