More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3193 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
895 aa  1778    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  36.52 
 
 
864 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
881 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  37.79 
 
 
872 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  38.22 
 
 
866 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  32.49 
 
 
867 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  33.3 
 
 
862 aa  304  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  33.45 
 
 
872 aa  291  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.16 
 
 
1006 aa  144  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
973 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 
983 aa  127  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 
967 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  31.89 
 
 
916 aa  118  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.01 
 
 
992 aa  116  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  34.88 
 
 
1123 aa  115  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  30.38 
 
 
1054 aa  111  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.83 
 
 
1029 aa  104  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  29.9 
 
 
982 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.28 
 
 
1123 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  30.08 
 
 
937 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 
900 aa  95.1  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  27.84 
 
 
981 aa  94.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  29.06 
 
 
967 aa  92.8  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.02 
 
 
1118 aa  92.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 
970 aa  91.7  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.25 
 
 
1121 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 
937 aa  90.5  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.33 
 
 
1190 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.47 
 
 
1116 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  30.16 
 
 
964 aa  87  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.53 
 
 
1029 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.07 
 
 
1075 aa  85.5  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  26.79 
 
 
993 aa  85.1  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.48 
 
 
1149 aa  84.7  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.71 
 
 
1034 aa  84.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.45 
 
 
1175 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  25.48 
 
 
1048 aa  84.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.06 
 
 
1071 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 
953 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  31.49 
 
 
1013 aa  82.4  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  26.12 
 
 
959 aa  82.8  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.75 
 
 
1067 aa  82.4  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.77 
 
 
1682 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.95 
 
 
1193 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  29.28 
 
 
957 aa  81.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.09 
 
 
1422 aa  81.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.51 
 
 
1114 aa  80.9  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.77 
 
 
1682 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.12 
 
 
1797 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.46 
 
 
1005 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.3 
 
 
1360 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  29.56 
 
 
1089 aa  79  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.94 
 
 
998 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 
927 aa  78.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  30.46 
 
 
999 aa  78.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.77 
 
 
1403 aa  78.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  20.38 
 
 
1147 aa  78.2  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 
1402 aa  77.8  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.89 
 
 
1151 aa  77  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  44.17 
 
 
574 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  27.76 
 
 
1022 aa  76.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  24.92 
 
 
1685 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.38 
 
 
1148 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.31 
 
 
1429 aa  75.1  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  49.49 
 
 
904 aa  75.5  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.79 
 
 
1198 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  31.54 
 
 
1153 aa  74.3  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26 
 
 
1141 aa  74.7  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.53 
 
 
1089 aa  74.7  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  28.33 
 
 
1118 aa  74.3  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  22.7 
 
 
1934 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26 
 
 
1141 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  40.56 
 
 
567 aa  73.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26 
 
 
1141 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  28.76 
 
 
905 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  28.95 
 
 
1051 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  23.67 
 
 
1020 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  28.22 
 
 
1118 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  28.65 
 
 
946 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.52 
 
 
1295 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.91 
 
 
2017 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.78 
 
 
1055 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.4 
 
 
1774 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 
1015 aa  70.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 
1942 aa  70.5  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.89 
 
 
1836 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.88 
 
 
1805 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26 
 
 
1291 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  29.13 
 
 
892 aa  69.7  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  24.09 
 
 
1805 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  20.24 
 
 
1932 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.78 
 
 
1081 aa  69.3  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  26.59 
 
 
1139 aa  68.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  26.55 
 
 
925 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.95 
 
 
1080 aa  68.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  26.15 
 
 
1833 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  26.15 
 
 
1141 aa  68.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 
1123 aa  68.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  26.84 
 
 
1712 aa  67.8  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>