More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1757 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 993 aa  1936    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  42.08 
 
 		 983 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  43.5 
 
 		 953 aa  472  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 982 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  36.47 
 
 		 916 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  38.26 
 
 		 967 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  34.45 
 
 		 1006 aa  389  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  34.03 
 
 		 954 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 992 aa  303  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 970 aa  284  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  29.97 
 
 		 1005 aa  253  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  36.83 
 
 		 967 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 973 aa  240  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  37.99 
 
 		 981 aa  219  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 1084 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 1013 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 999 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  31.4 
 
 		 964 aa  195  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.56 
 
 		 900 aa  179  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  35.89 
 
 		 937 aa  151  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  31.01 
 
 		 1022 aa  147  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  30.03 
 
 		 959 aa  144  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.39 
 
 		 1139 aa  134  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  27.23 
 
 		 1029 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 1015 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.06 
 
 		 1148 aa  121  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 		 1429 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.96 
 
 		 1134 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 1151 aa  114  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  27.32 
 
 		 1071 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.35 
 
 		 1151 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.61 
 
 		 1080 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.8 
 
 		 1422 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  28.99 
 
 		 1007 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.15 
 
 		 1122 aa  107  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.83 
 
 		 1081 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.11 
 
 		 1149 aa  106  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.92 
 
 		 1089 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  27.73 
 
 		 973 aa  105  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.6 
 
 		 1034 aa  104  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.09 
 
 		 1227 aa  104  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.37 
 
 		 1160 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 895 aa  103  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  27.83 
 
 		 1048 aa  102  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  26.82 
 
 		 1054 aa  100  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  23.54 
 
 		 1020 aa  100  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 1116 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 1118 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.94 
 
 		 1109 aa  99  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  29.38 
 
 		 1123 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.1 
 
 		 1141 aa  98.6  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.21 
 
 		 1105 aa  98.6  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1400 aa  98.2  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  25.94 
 
 		 1142 aa  95.1  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.13 
 
 		 1029 aa  95.1  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.62 
 
 		 1123 aa  95.1  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.3 
 
 		 1175 aa  95.5  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  25.53 
 
 		 1138 aa  94.7  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 		 1422 aa  94.7  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.3 
 
 		 1271 aa  94.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  25.85 
 
 		 1051 aa  94.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  30.18 
 
 		 1013 aa  94  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  30.96 
 
 		 937 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.21 
 
 		 1403 aa  93.6  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.89 
 
 		 1118 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  26.65 
 
 		 914 aa  92.8  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.54 
 
 		 1075 aa  92.8  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.26 
 
 		 1126 aa  92.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  25.76 
 
 		 1123 aa  92.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  28.06 
 
 		 977 aa  92.4  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25 
 
 		 1441 aa  92.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.03 
 
 		 713 aa  92.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.89 
 
 		 1118 aa  91.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.26 
 
 		 1291 aa  91.7  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 		 1398 aa  91.3  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  24.94 
 
 		 1264 aa  90.5  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.28 
 
 		 1055 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.56 
 
 		 1295 aa  90.9  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 1198 aa  89.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  28.35 
 
 		 862 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 881 aa  87.8  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.79 
 
 		 1067 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 		 1403 aa  87.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 		 966 aa  87.4  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.33 
 
 		 1037 aa  87  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.54 
 
 		 1795 aa  85.9  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.89 
 
 		 1050 aa  85.1  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.89 
 
 		 1050 aa  85.1  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.62 
 
 		 1150 aa  84.7  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.31 
 
 		 1094 aa  84.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.15 
 
 		 1774 aa  84.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 1188 aa  83.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  23.88 
 
 		 864 aa  82.4  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.3 
 
 		 1121 aa  82  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  24.21 
 
 		 1148 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26.73 
 
 		 1311 aa  81.6  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.78 
 
 		 1053 aa  81.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.62 
 
 		 1133 aa  81.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 723 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 975 aa  80.5  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>