More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5617 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1151 aa  2327    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  60.28 
 
 
1139 aa  1278    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  62.75 
 
 
1138 aa  1321    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  57.5 
 
 
1141 aa  1243    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  56.61 
 
 
1149 aa  1193    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  89.49 
 
 
1148 aa  2044    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  98.52 
 
 
1151 aa  2299    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.1 
 
 
1117 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 
1105 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  35.07 
 
 
1122 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
1048 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  38.37 
 
 
1063 aa  389  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  33.06 
 
 
1134 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
1037 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 
1403 aa  358  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.98 
 
 
1080 aa  357  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  30.05 
 
 
1377 aa  356  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.85 
 
 
1081 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.65 
 
 
1089 aa  329  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  32.01 
 
 
1093 aa  325  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
1402 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34 
 
 
1175 aa  307  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 
1046 aa  307  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.7 
 
 
1291 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 
1043 aa  293  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  28.74 
 
 
1065 aa  290  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  28.39 
 
 
1055 aa  290  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 
1160 aa  286  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.53 
 
 
1053 aa  283  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  29.49 
 
 
1227 aa  280  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.77 
 
 
1055 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  29.37 
 
 
1050 aa  270  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.37 
 
 
1050 aa  270  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.62 
 
 
1014 aa  265  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  28.08 
 
 
1123 aa  244  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 
1429 aa  242  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.46 
 
 
1142 aa  238  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 
1398 aa  234  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.04 
 
 
1126 aa  233  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.14 
 
 
1094 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.77 
 
 
1403 aa  226  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  30.92 
 
 
1198 aa  219  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.99 
 
 
1133 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.04 
 
 
1422 aa  219  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.47 
 
 
1360 aa  214  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.2 
 
 
1023 aa  211  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 
1311 aa  206  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
1298 aa  205  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1295 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.44 
 
 
1441 aa  194  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.72 
 
 
1285 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.13 
 
 
1271 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  27.18 
 
 
1027 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  27.18 
 
 
1027 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  26.34 
 
 
1204 aa  185  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 
1349 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 
1349 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1342 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.79 
 
 
1226 aa  184  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  26.35 
 
 
1027 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  25.05 
 
 
1349 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.59 
 
 
1087 aa  179  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.65 
 
 
1358 aa  178  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  24.68 
 
 
1348 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.03 
 
 
1190 aa  174  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.73 
 
 
1096 aa  171  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.25 
 
 
1067 aa  170  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  25.54 
 
 
1353 aa  164  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  25.68 
 
 
1359 aa  163  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  25.56 
 
 
1213 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  25.56 
 
 
1359 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  25.56 
 
 
1359 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  25.56 
 
 
1359 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  25.56 
 
 
1359 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  25.56 
 
 
1350 aa  157  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  20.95 
 
 
1153 aa  155  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.17 
 
 
1264 aa  153  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 
1190 aa  152  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  25.5 
 
 
1289 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 
1015 aa  131  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 
966 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
956 aa  129  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.44 
 
 
805 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  31.56 
 
 
320 aa  127  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  31.56 
 
 
320 aa  127  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  30.05 
 
 
961 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  24.78 
 
 
1130 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.55 
 
 
735 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 
665 aa  122  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  28.54 
 
 
993 aa  121  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.31 
 
 
1193 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  31.17 
 
 
965 aa  118  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.23 
 
 
1034 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.89 
 
 
1468 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  25.1 
 
 
1029 aa  115  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
1320 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 
983 aa  113  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  26.67 
 
 
1055 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.23 
 
 
919 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.84 
 
 
1190 aa  111  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>