More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6475 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  100 
 
 
1175 aa  2362    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  37.27 
 
 
1227 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  41.83 
 
 
1122 aa  525  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  37.36 
 
 
1048 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  38.78 
 
 
1105 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  41.17 
 
 
1043 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  35.09 
 
 
1046 aa  403  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  40.34 
 
 
1065 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  32.58 
 
 
1055 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  34.56 
 
 
1037 aa  318  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.04 
 
 
1141 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  33.24 
 
 
1138 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
1148 aa  314  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 
1403 aa  305  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  32.7 
 
 
1139 aa  300  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 
1151 aa  297  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 
1151 aa  296  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  27.01 
 
 
1134 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.81 
 
 
1149 aa  284  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.75 
 
 
1089 aa  278  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  33.06 
 
 
1377 aa  274  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.96 
 
 
1429 aa  264  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.12 
 
 
1422 aa  261  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.44 
 
 
1096 aa  260  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.78 
 
 
1080 aa  259  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.1 
 
 
1081 aa  259  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.36 
 
 
1291 aa  248  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.91 
 
 
1087 aa  248  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 
1402 aa  247  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 
1160 aa  244  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  31.26 
 
 
1027 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  31.26 
 
 
1027 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  31.36 
 
 
1027 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.54 
 
 
1117 aa  237  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28.47 
 
 
1093 aa  237  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 
1398 aa  235  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  29.4 
 
 
1358 aa  235  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.68 
 
 
1360 aa  224  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.18 
 
 
1055 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.82 
 
 
1023 aa  220  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.31 
 
 
1014 aa  218  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 
1022 aa  216  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.86 
 
 
1403 aa  212  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.97 
 
 
1123 aa  211  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.55 
 
 
1441 aa  207  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.88 
 
 
1142 aa  204  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  28.7 
 
 
1050 aa  204  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.7 
 
 
1050 aa  204  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  29.37 
 
 
1133 aa  201  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.55 
 
 
1094 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  27.69 
 
 
1271 aa  199  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.74 
 
 
1053 aa  199  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.69 
 
 
1198 aa  198  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  28.78 
 
 
1063 aa  193  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
1311 aa  189  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.41 
 
 
914 aa  187  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
1298 aa  181  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
1348 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  27.79 
 
 
1349 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 
1295 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  30.7 
 
 
1353 aa  172  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  30.46 
 
 
1213 aa  158  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  30.46 
 
 
1350 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  29.64 
 
 
1349 aa  157  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  29.64 
 
 
1349 aa  157  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  30.46 
 
 
1359 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  30.46 
 
 
1359 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  30.99 
 
 
1359 aa  157  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  30.46 
 
 
1359 aa  157  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 
1359 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
1342 aa  155  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 
956 aa  148  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.26 
 
 
1190 aa  149  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  21.41 
 
 
1153 aa  145  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.41 
 
 
1226 aa  141  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.6 
 
 
1264 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.57 
 
 
1067 aa  134  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.57 
 
 
805 aa  129  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  27.54 
 
 
900 aa  129  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  27.24 
 
 
1204 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  26.46 
 
 
1132 aa  127  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  28.54 
 
 
1383 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  24.91 
 
 
1114 aa  125  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.24 
 
 
1006 aa  124  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  39.25 
 
 
665 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.51 
 
 
1190 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  31.47 
 
 
954 aa  121  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  32.81 
 
 
513 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  25.89 
 
 
1005 aa  116  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.62 
 
 
967 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  23.94 
 
 
1020 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1682  putative adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1071 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
973 aa  114  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
1346 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  25.69 
 
 
1150 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.41 
 
 
1126 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  25.97 
 
 
1071 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  30.02 
 
 
1034 aa  109  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.81 
 
 
701 aa  108  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  24.29 
 
 
1130 aa  108  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>