More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0848 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 
967 aa  717    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
973 aa  701    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
954 aa  1824    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  36.72 
 
 
959 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  37.64 
 
 
1084 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 
900 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  39.48 
 
 
992 aa  419  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  35.81 
 
 
1013 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 
999 aa  363  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 
982 aa  332  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  35.4 
 
 
916 aa  323  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  33.2 
 
 
993 aa  316  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 
1005 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 
981 aa  309  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 
983 aa  298  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  34.74 
 
 
1006 aa  273  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  32.66 
 
 
964 aa  242  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 
970 aa  238  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  41.09 
 
 
953 aa  213  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 
967 aa  198  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
895 aa  195  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 
937 aa  194  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  33.59 
 
 
1022 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  37.6 
 
 
1054 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
881 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  30.75 
 
 
1134 aa  134  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  33.69 
 
 
1029 aa  134  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  29.6 
 
 
1020 aa  131  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.96 
 
 
1429 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  29.17 
 
 
1034 aa  130  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.04 
 
 
1175 aa  127  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.25 
 
 
1116 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  33.42 
 
 
1118 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.71 
 
 
1029 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  31.54 
 
 
1007 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.88 
 
 
1291 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.85 
 
 
1015 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.22 
 
 
1422 aa  122  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.67 
 
 
1080 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.25 
 
 
1081 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  32.47 
 
 
1051 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.24 
 
 
1668 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 
1105 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  30.92 
 
 
713 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  34.05 
 
 
1109 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  32.1 
 
 
965 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.05 
 
 
1227 aa  118  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 
1160 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 
1403 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  33.07 
 
 
1055 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  33.46 
 
 
867 aa  115  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  33.94 
 
 
1123 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  26.95 
 
 
1712 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.79 
 
 
1067 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.17 
 
 
1055 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  33.24 
 
 
1121 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30.63 
 
 
1118 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
1402 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  30.63 
 
 
1118 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 
864 aa  111  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.62 
 
 
1663 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.62 
 
 
1122 aa  111  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.98 
 
 
1075 aa  110  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 
1037 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  32.3 
 
 
1013 aa  109  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  29.64 
 
 
1071 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.53 
 
 
1295 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  31.77 
 
 
1342 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  29.66 
 
 
862 aa  106  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 
956 aa  105  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  33.42 
 
 
1193 aa  105  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.77 
 
 
1150 aa  104  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
1383 aa  104  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
1139 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  31.22 
 
 
1349 aa  104  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 
1050 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  31.22 
 
 
1349 aa  104  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.35 
 
 
1050 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  30.05 
 
 
977 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  29.93 
 
 
723 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  28.46 
 
 
1148 aa  103  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  31.39 
 
 
1190 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
1349 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  28.18 
 
 
1271 aa  102  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 
1348 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  21.63 
 
 
2279 aa  101  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  32.98 
 
 
963 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  25.18 
 
 
1833 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.23 
 
 
1403 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30.16 
 
 
1141 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
1043 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30.16 
 
 
1141 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.3 
 
 
1797 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.02 
 
 
1148 aa  100  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.45 
 
 
1141 aa  99  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  30.14 
 
 
1027 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.21 
 
 
1780 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
1027 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
1027 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 
1046 aa  98.6  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>