More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5519 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  42.04 
 
 
1192 aa  749    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1188 aa  2343    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40.08 
 
 
1131 aa  579  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0224  serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 
1295 aa  386  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 
1377 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2768  serine/threonine protein kinase  34.28 
 
 
1446 aa  365  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  35.65 
 
 
1297 aa  355  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2767  serine/threonine protein kinase  39.91 
 
 
1514 aa  290  8e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 
1235 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 
1096 aa  167  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  25.61 
 
 
1805 aa  144  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 
1932 aa  143  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3726  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 
351 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3652  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 
363 aa  142  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3707  protein kinase  32.6 
 
 
348 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  24.52 
 
 
1850 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  50.35 
 
 
598 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3586  serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 
363 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  48.67 
 
 
591 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  46.9 
 
 
593 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.03 
 
 
1836 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  39.67 
 
 
619 aa  127  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  24.33 
 
 
1914 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  27.18 
 
 
1809 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  23.98 
 
 
2051 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  21.39 
 
 
670 aa  121  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  40.13 
 
 
651 aa  121  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.28 
 
 
1780 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
1320 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.45 
 
 
1804 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  21.9 
 
 
1057 aa  119  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  26.59 
 
 
1833 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.05 
 
 
602 aa  118  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.6 
 
 
1822 aa  118  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  26.84 
 
 
1710 aa  118  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.9 
 
 
2017 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 
641 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.68 
 
 
1774 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.82 
 
 
667 aa  117  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  41.83 
 
 
557 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  29.31 
 
 
1885 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
517 aa  117  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  26.31 
 
 
1837 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
1346 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.58 
 
 
1794 aa  116  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.66 
 
 
1797 aa  116  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.18 
 
 
1845 aa  116  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  39.55 
 
 
763 aa  114  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  25.37 
 
 
2272 aa  114  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7753  serine/threonine protein kinase  43.31 
 
 
489 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
444 aa  114  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  25.52 
 
 
2303 aa  114  9e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  40.13 
 
 
611 aa  114  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 
1152 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.06 
 
 
747 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.61 
 
 
863 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 
1644 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.2 
 
 
916 aa  114  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
582 aa  112  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  42.31 
 
 
1032 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.61 
 
 
2077 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  42.31 
 
 
1032 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.18 
 
 
503 aa  112  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.74 
 
 
1805 aa  112  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.51 
 
 
614 aa  112  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.78 
 
 
553 aa  112  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  43.41 
 
 
520 aa  112  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 
503 aa  111  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 
1400 aa  111  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 
646 aa  111  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 
316 aa  111  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  24.69 
 
 
2361 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.76 
 
 
1110 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
678 aa  110  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 
610 aa  110  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.19 
 
 
1908 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  32.65 
 
 
320 aa  110  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.18 
 
 
880 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.31 
 
 
658 aa  110  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  44.03 
 
 
344 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  39.29 
 
 
403 aa  109  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.61 
 
 
620 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 
596 aa  109  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
468 aa  109  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.61 
 
 
681 aa  109  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
1637 aa  108  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
1942 aa  108  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 
382 aa  108  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.21 
 
 
1795 aa  108  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 
611 aa  108  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  35.53 
 
 
692 aa  108  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.85 
 
 
499 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3142  serine/threonine protein kinase  37.77 
 
 
499 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0617984  normal  0.649612 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.86 
 
 
681 aa  107  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  40.11 
 
 
581 aa  107  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  37.76 
 
 
761 aa  107  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 
468 aa  106  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  33.51 
 
 
618 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
612 aa  107  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.18 
 
 
641 aa  107  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>