More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3408 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  95.44 
 
 		 1116 aa  1896    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  99.46 
 
 		 1118 aa  2094    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  65.05 
 
 		 1109 aa  1125    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  100 
 
 		 1118 aa  2111    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 1193 aa  174  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.3 
 
 		 1055 aa  165  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.98 
 
 		 1075 aa  164  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 1190 aa  162  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.44 
 
 		 1067 aa  158  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.41 
 
 		 1029 aa  153  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.28 
 
 		 999 aa  125  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.05 
 
 		 1034 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 954 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  31.65 
 
 		 1054 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  27.13 
 
 		 1139 aa  115  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 973 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 983 aa  115  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.08 
 
 		 1029 aa  114  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  29.59 
 
 		 1143 aa  113  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.73 
 
 		 1013 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.08 
 
 		 572 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 975 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 992 aa  112  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 1089 aa  110  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  27.25 
 
 		 1183 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  28.88 
 
 		 494 aa  109  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  35.81 
 
 		 597 aa  109  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.83 
 
 		 1022 aa  108  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.63 
 
 		 1126 aa  108  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 1216 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 1015 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  28.59 
 
 		 1148 aa  103  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 981 aa  101  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 		 1013 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.19 
 
 		 713 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  28.98 
 
 		 982 aa  100  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.99 
 
 		 1006 aa  99.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 1064 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  27.18 
 
 		 959 aa  99  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 1198 aa  98.6  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 993 aa  98.6  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 1141 aa  98.6  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 		 967 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 953 aa  97.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  33.09 
 
 		 1204 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  32 
 
 		 1095 aa  95.9  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  32.4 
 
 		 1094 aa  95.5  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  32.17 
 
 		 1097 aa  94.7  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.37 
 
 		 916 aa  94.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.77 
 
 		 1123 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.66 
 
 		 1118 aa  94  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 1141 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.52 
 
 		 561 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.53 
 
 		 1160 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 965 aa  94.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  30.42 
 
 		 1108 aa  93.2  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  32.6 
 
 		 1163 aa  92.8  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 895 aa  92.8  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  27.05 
 
 		 1071 aa  92.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.49 
 
 		 1005 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.79 
 
 		 1141 aa  92  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  33.01 
 
 		 914 aa  92.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  27.18 
 
 		 1123 aa  92  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  27.52 
 
 		 1121 aa  90.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 1141 aa  90.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 1141 aa  90.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  30.61 
 
 		 1122 aa  89.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  29.36 
 
 		 1132 aa  89.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  33.33 
 
 		 1145 aa  89.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  30.92 
 
 		 1084 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  29.44 
 
 		 964 aa  89  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  29.86 
 
 		 1114 aa  89  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.82 
 
 		 1089 aa  89  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 		 1007 aa  87.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 1235 aa  87.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  30.08 
 
 		 661 aa  87  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.98 
 
 		 1422 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.8 
 
 		 1119 aa  86.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.66 
 
 		 1123 aa  85.9  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  29.22 
 
 		 970 aa  85.9  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 872 aa  85.1  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 881 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  30.58 
 
 		 1061 aa  84.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  27.31 
 
 		 1082 aa  84  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.64 
 
 		 1134 aa  83.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  32.59 
 
 		 1044 aa  84  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.21 
 
 		 1227 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 775 aa  83.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  29.69 
 
 		 1083 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.23 
 
 		 1291 aa  82.8  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  25.74 
 
 		 1055 aa  82  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 723 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.06 
 
 		 1149 aa  80.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.93 
 
 		 1175 aa  80.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.51 
 
 		 1441 aa  80.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.98 
 
 		 1117 aa  79.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  28.99 
 
 		 1051 aa  79.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.35 
 
 		 1105 aa  78.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  28.34 
 
 		 864 aa  78.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  29.01 
 
 		 947 aa  78.2  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>