More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3812 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  44.18 
 
 		 959 aa  653    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 927 aa  1816    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 1000 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 910 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 876 aa  327  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 881 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 881 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  32.97 
 
 		 893 aa  320  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 894 aa  296  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 953 aa  288  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1352  tetratricopeptide TPR_4  31.24 
 
 		 683 aa  190  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  26.24 
 
 		 917 aa  135  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 		 907 aa  134  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 919 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  26.67 
 
 		 919 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  30.34 
 
 		 928 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  26.46 
 
 		 919 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  31.8 
 
 		 919 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  27.18 
 
 		 930 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  28.76 
 
 		 940 aa  107  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  28.63 
 
 		 909 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 921 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  26.73 
 
 		 921 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  26.73 
 
 		 921 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 		 946 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  30.57 
 
 		 913 aa  103  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 189 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  28.73 
 
 		 918 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  28.1 
 
 		 922 aa  100  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 910 aa  97.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 889 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 236 aa  94.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 894 aa  94.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  31.51 
 
 		 955 aa  94.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 925 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 967 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 1015 aa  89.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  29.64 
 
 		 903 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 953 aa  88.2  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 937 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  39.73 
 
 		 937 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  39.73 
 
 		 937 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  31.81 
 
 		 932 aa  87.4  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  29.8 
 
 		 936 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.19 
 
 		 1067 aa  85.9  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  28.96 
 
 		 929 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  28.1 
 
 		 934 aa  85.1  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.83 
 
 		 923 aa  84.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.81 
 
 		 1071 aa  84.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 950 aa  83.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 900 aa  83.2  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  29.09 
 
 		 961 aa  83.2  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 956 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  40.52 
 
 		 905 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.18 
 
 		 1013 aa  82  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  29.55 
 
 		 1121 aa  82  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  31.32 
 
 		 892 aa  80.9  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  29.8 
 
 		 960 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  27.47 
 
 		 1123 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 1148 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 927 aa  79.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.47 
 
 		 1075 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.34 
 
 		 954 aa  79  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 895 aa  78.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  27.85 
 
 		 992 aa  78.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  28.88 
 
 		 884 aa  78.2  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 913 aa  78.2  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 973 aa  77.8  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.02 
 
 		 1118 aa  77.8  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  27.69 
 
 		 1123 aa  76.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.93 
 
 		 1080 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 928 aa  75.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  28.49 
 
 		 916 aa  75.5  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 		 983 aa  75.5  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  28.21 
 
 		 1053 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 940 aa  74.3  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  26.53 
 
 		 1029 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.55 
 
 		 1029 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.94 
 
 		 1126 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.39 
 
 		 1114 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 951 aa  72  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  29.71 
 
 		 1163 aa  72  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.63 
 
 		 1089 aa  71.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.55 
 
 		 1005 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 881 aa  71.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  41.18 
 
 		 913 aa  71.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.62 
 
 		 1175 aa  71.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  28.81 
 
 		 923 aa  71.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 916 aa  71.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  26.42 
 
 		 1022 aa  70.5  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 923 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  32.84 
 
 		 921 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 879 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 877 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 867 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  43.09 
 
 		 904 aa  69.7  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  29.36 
 
 		 918 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>