More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1300 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 910 aa  1746    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 881 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 881 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 876 aa  555  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  44.97 
 
 		 893 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  46.11 
 
 		 894 aa  522  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 		 927 aa  362  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  35.17 
 
 		 959 aa  320  7.999999999999999e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1352  tetratricopeptide TPR_4  39.22 
 
 		 683 aa  313  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 1000 aa  265  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  59.68 
 
 		 189 aa  207  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.99 
 
 		 953 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  26.62 
 
 		 927 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  40.89 
 
 		 929 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  39.22 
 
 		 919 aa  100  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  39.39 
 
 		 921 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  36.99 
 
 		 977 aa  98.6  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  35.34 
 
 		 921 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 921 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  35.34 
 
 		 921 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 919 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  37.89 
 
 		 919 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  36.84 
 
 		 919 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 953 aa  92  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 923 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  42.36 
 
 		 894 aa  91.3  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 950 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  41.18 
 
 		 919 aa  89.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 913 aa  88.6  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 937 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 937 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 937 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  36.76 
 
 		 900 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 889 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 		 916 aa  85.9  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 903 aa  86.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  38.97 
 
 		 940 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 910 aa  84.7  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 928 aa  82.4  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.57 
 
 		 923 aa  82.8  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  27.93 
 
 		 961 aa  82.4  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  45.67 
 
 		 915 aa  81.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  28.22 
 
 		 927 aa  80.9  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 897 aa  80.5  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  38.26 
 
 		 929 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  27.95 
 
 		 918 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  43.31 
 
 		 923 aa  79  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 904 aa  78.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 		 938 aa  77.8  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  39.55 
 
 		 940 aa  77.8  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  36 
 
 		 936 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 995 aa  77  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  35.1 
 
 		 937 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  43.33 
 
 		 884 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 947 aa  76.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  40.82 
 
 		 879 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  38.24 
 
 		 930 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  38.66 
 
 		 928 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  41.8 
 
 		 928 aa  74.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 911 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 877 aa  73.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 946 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 998 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  43.8 
 
 		 892 aa  73.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  39.77 
 
 		 932 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  40 
 
 		 884 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  40.65 
 
 		 913 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 907 aa  72.4  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 973 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  34.97 
 
 		 925 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  40.32 
 
 		 913 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  35.5 
 
 		 955 aa  70.1  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  39.67 
 
 		 981 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  42.54 
 
 		 960 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 1052 aa  68.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 		 923 aa  68.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 544 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 544 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 544 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 946 aa  67  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.03 
 
 		 981 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  42.55 
 
 		 909 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  34.92 
 
 		 855 aa  65.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  44.58 
 
 		 948 aa  65.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  43.88 
 
 		 956 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  37.11 
 
 		 919 aa  64.7  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  29.02 
 
 		 917 aa  63.9  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 953 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  37.75 
 
 		 951 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  34.32 
 
 		 905 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 845 aa  63.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  32.7 
 
 		 922 aa  63.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 910 aa  62.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  37.82 
 
 		 929 aa  62.4  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  50.82 
 
 		 204 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 554 aa  62  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  62  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>