45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1352 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1352  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 683 aa  1300    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  58.12 
 
 		 881 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  58.12 
 
 		 881 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 876 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  50.37 
 
 		 893 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  50.81 
 
 		 894 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 910 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  31.45 
 
 		 927 aa  195  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 1000 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 959 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  27.92 
 
 		 953 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 901 aa  70.5  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  30.02 
 
 		 909 aa  67.4  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 928 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  30.66 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  26.52 
 
 		 927 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 940 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  27.6 
 
 		 925 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  27.05 
 
 		 930 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  27.03 
 
 		 955 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  29.64 
 
 		 913 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 940 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 974 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  29.58 
 
 		 913 aa  51.6  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  27.88 
 
 		 884 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 950 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  27.48 
 
 		 911 aa  48.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 940 aa  47.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  24.44 
 
 		 920 aa  47.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.9 
 
 		 1066 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  28.24 
 
 		 907 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  30.9 
 
 		 955 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  32.34 
 
 		 868 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 		 947 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 965 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  26.32 
 
 		 460 aa  45.8  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  31.23 
 
 		 884 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.91 
 
 		 1780 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  28.47 
 
 		 917 aa  44.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  28.93 
 
 		 928 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 956 aa  44.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  26.16 
 
 		 1123 aa  44.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.4 
 
 		 1067 aa  44.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  29.15 
 
 		 1007 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  35.2 
 
 		 929 aa  44.3  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>