More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0244 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  100 
 
 
868 aa  1694    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 
884 aa  287  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  31.57 
 
 
880 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  32.82 
 
 
865 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  30.45 
 
 
864 aa  243  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  32.38 
 
 
867 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  29.11 
 
 
884 aa  235  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  30.68 
 
 
879 aa  203  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  35.22 
 
 
871 aa  174  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  31.65 
 
 
562 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
907 aa  120  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
926 aa  110  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  27.66 
 
 
908 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 
893 aa  104  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  28.47 
 
 
845 aa  99  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  26.88 
 
 
1001 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  28.23 
 
 
292 aa  87.8  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  30.5 
 
 
690 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  30.5 
 
 
690 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  30.5 
 
 
690 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
894 aa  82.8  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  28.67 
 
 
903 aa  79  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  28.72 
 
 
660 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  25.8 
 
 
910 aa  75.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  27.93 
 
 
640 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  24.8 
 
 
919 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  24.72 
 
 
919 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  24.72 
 
 
919 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.37 
 
 
881 aa  62  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 
231 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 
231 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.02 
 
 
1141 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  29.02 
 
 
1141 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2963  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 
219 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  26.23 
 
 
916 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 
876 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  59.32 
 
 
907 aa  57.4  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  29.02 
 
 
1141 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
231 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 
218 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  28.41 
 
 
966 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 
231 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  53.57 
 
 
231 aa  57  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.06 
 
 
226 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 
959 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
235 aa  55.1  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 
901 aa  55.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.03 
 
 
836 aa  55.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  24.95 
 
 
912 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  24.82 
 
 
893 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
556 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  35.9 
 
 
567 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 
229 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  42.31 
 
 
937 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.11 
 
 
862 aa  52.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
224 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.46 
 
 
215 aa  52.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
222 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  34.4 
 
 
574 aa  52.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
215 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
233 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 
220 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
856 aa  51.6  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  25.62 
 
 
1198 aa  51.6  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
245 aa  51.6  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
245 aa  51.6  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
226 aa  51.6  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  43.1 
 
 
934 aa  51.2  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 
230 aa  51.2  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 
550 aa  51.6  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
755 aa  51.2  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 
217 aa  51.2  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 
224 aa  51.2  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
238 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
1000 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 
1089 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 
270 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.66 
 
 
853 aa  50.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.3 
 
 
222 aa  50.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  42.59 
 
 
231 aa  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1855  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
76 aa  50.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.101838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
242 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 
386 aa  50.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  42.37 
 
 
242 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  44.64 
 
 
242 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  39.68 
 
 
217 aa  50.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 
221 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 
998 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 
214 aa  49.3  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
216 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  28.07 
 
 
925 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
814 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
877 aa  49.3  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 
223 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
223 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  44.64 
 
 
233 aa  49.3  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  44.64 
 
 
242 aa  49.3  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 
224 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
223 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 
982 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>