More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5800 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  100 
 
 		 919 aa  1742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  44 
 
 		 913 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  42.9 
 
 		 884 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  41.92 
 
 		 909 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  41.81 
 
 		 938 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  40.59 
 
 		 911 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 928 aa  439  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  40.4 
 
 		 879 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  39.67 
 
 		 946 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 940 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  37.54 
 
 		 913 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  40.85 
 
 		 884 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  35.67 
 
 		 917 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  36.56 
 
 		 925 aa  386  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  38.9 
 
 		 928 aa  383  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  41.68 
 
 		 904 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  38.45 
 
 		 923 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 937 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.63 
 
 		 937 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  36.85 
 
 		 928 aa  357  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  36.73 
 
 		 937 aa  354  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  38.23 
 
 		 920 aa  354  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 905 aa  351  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  37.09 
 
 		 930 aa  348  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  37.08 
 
 		 940 aa  348  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  36.21 
 
 		 929 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 		 995 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  35.2 
 
 		 927 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 913 aa  333  6e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 		 903 aa  333  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  37.92 
 
 		 910 aa  327  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  37.22 
 
 		 918 aa  323  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  37.46 
 
 		 936 aa  323  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.53 
 
 		 923 aa  318  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 929 aa  312  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  37.55 
 
 		 919 aa  311  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  32.9 
 
 		 922 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  35.52 
 
 		 927 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  33.3 
 
 		 961 aa  259  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 889 aa  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 950 aa  245  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 915 aa  240  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  36.77 
 
 		 916 aa  230  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 835 aa  217  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  30.25 
 
 		 919 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 919 aa  209  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.25 
 
 		 919 aa  209  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  39.77 
 
 		 894 aa  194  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  37.42 
 
 		 955 aa  184  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  37.19 
 
 		 934 aa  177  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  38.44 
 
 		 923 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 953 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  33.54 
 
 		 923 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 1064 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 876 aa  138  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 881 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 881 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  39.09 
 
 		 977 aa  135  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  28.92 
 
 		 893 aa  134  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  31.35 
 
 		 927 aa  128  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  41.67 
 
 		 240 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  35.51 
 
 		 892 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  38.28 
 
 		 921 aa  118  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 921 aa  118  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  35.6 
 
 		 921 aa  118  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  35.29 
 
 		 921 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  36.53 
 
 		 929 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 998 aa  108  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  34.03 
 
 		 959 aa  107  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  44.52 
 
 		 894 aa  107  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 1000 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  35.81 
 
 		 897 aa  101  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 189 aa  98.2  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  34.68 
 
 		 900 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  41.96 
 
 		 946 aa  94.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 877 aa  91.7  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  39.9 
 
 		 919 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  28.37 
 
 		 918 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 910 aa  89.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 948 aa  85.5  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  28.14 
 
 		 908 aa  85.1  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.61 
 
 		 947 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  40.79 
 
 		 951 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  36.95 
 
 		 974 aa  82  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 953 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  38.95 
 
 		 973 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 		 932 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 943 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.56 
 
 		 947 aa  75.1  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 950 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 1085 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  34.41 
 
 		 574 aa  72  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 956 aa  71.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.49 
 
 		 900 aa  71.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 960 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 997 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.54 
 
 		 1193 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  40.25 
 
 		 952 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 		 981 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>