More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0554 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  57.63 
 
 
946 aa  837    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
948 aa  1803    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  42.07 
 
 
952 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.97 
 
 
947 aa  358  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 
998 aa  349  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  36.43 
 
 
974 aa  337  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  35.6 
 
 
960 aa  309  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 
940 aa  305  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  41.11 
 
 
951 aa  173  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  45.31 
 
 
855 aa  170  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 
943 aa  154  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.33 
 
 
947 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  49.73 
 
 
932 aa  136  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  30.88 
 
 
925 aa  129  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 
998 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
877 aa  106  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.86 
 
 
1029 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 
908 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
937 aa  99  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  35.44 
 
 
937 aa  99  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  25.84 
 
 
919 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  35.44 
 
 
937 aa  99  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.22 
 
 
1668 aa  99  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  36.8 
 
 
919 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  31.66 
 
 
943 aa  96.3  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
994 aa  92  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 
941 aa  91.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.99 
 
 
713 aa  91.3  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  29.84 
 
 
723 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 
910 aa  90.1  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  39.13 
 
 
940 aa  89  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  28.73 
 
 
953 aa  88.2  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
921 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  50.94 
 
 
921 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  47.11 
 
 
921 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  30.4 
 
 
1685 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 
938 aa  85.9  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 
925 aa  86.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.96 
 
 
1663 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 
927 aa  85.9  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 
918 aa  84.7  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 
894 aa  84.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.91 
 
 
1055 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  30.4 
 
 
1685 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  35.66 
 
 
913 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  31.4 
 
 
855 aa  82  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  26.12 
 
 
1833 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.54 
 
 
1015 aa  82  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.4 
 
 
983 aa  82  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  46.34 
 
 
892 aa  82  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
881 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.12 
 
 
1118 aa  81.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 
923 aa  81.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  38.05 
 
 
884 aa  81.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
881 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
881 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  50.51 
 
 
913 aa  80.9  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
876 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.26 
 
 
1121 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.19 
 
 
928 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
895 aa  80.1  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  37.43 
 
 
940 aa  80.1  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  41.18 
 
 
929 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.42 
 
 
1122 aa  79.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 
894 aa  78.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.43 
 
 
917 aa  78.2  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.6 
 
 
900 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  31.61 
 
 
963 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
889 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.16 
 
 
1006 aa  77.4  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  37.14 
 
 
336 aa  77  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  28.78 
 
 
1114 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 
928 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  43.18 
 
 
930 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  27.16 
 
 
992 aa  77  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  27.57 
 
 
919 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.41 
 
 
1055 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  22.06 
 
 
1908 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.33 
 
 
954 aa  76.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.11 
 
 
1822 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  29.53 
 
 
923 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 
966 aa  76.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  26.38 
 
 
1697 aa  75.5  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  59.21 
 
 
900 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  30.23 
 
 
1139 aa  75.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  31.76 
 
 
955 aa  75.5  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  47.92 
 
 
919 aa  74.7  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 
903 aa  74.7  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 
956 aa  74.7  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  31.99 
 
 
939 aa  74.3  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 
921 aa  74.3  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 
929 aa  73.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28.79 
 
 
1141 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
910 aa  74.3  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28.79 
 
 
1141 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  40.77 
 
 
936 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  29.02 
 
 
1005 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 
931 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  31.41 
 
 
1148 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
1340 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>