More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1434 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 943 aa  1739    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 974 aa  342  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 952 aa  307  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  37.46 
 
 		 946 aa  306  8.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.74 
 
 		 947 aa  304  6.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  39.08 
 
 		 951 aa  302  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  36.63 
 
 		 932 aa  302  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 998 aa  293  7e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 940 aa  280  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.06 
 
 		 947 aa  258  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  38.87 
 
 		 960 aa  234  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 948 aa  193  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  34.9 
 
 		 855 aa  156  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  35.81 
 
 		 1104 aa  151  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  31.57 
 
 		 928 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 876 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 1141 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 1141 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 1141 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 1141 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  30.56 
 
 		 919 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 1148 aa  107  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 877 aa  101  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  28.73 
 
 		 923 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  29.21 
 
 		 943 aa  99.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.16 
 
 		 1029 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  27.72 
 
 		 919 aa  98.2  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 1118 aa  91.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 1198 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  31.23 
 
 		 908 aa  89.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 881 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 881 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 1151 aa  87.8  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  26.61 
 
 		 2051 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.25 
 
 		 1055 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 941 aa  86.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 983 aa  85.9  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.35 
 
 		 1054 aa  85.9  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.51 
 
 		 2017 aa  85.9  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 		 1908 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.05 
 
 		 923 aa  84.7  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 889 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.91 
 
 		 1805 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 1015 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  37.42 
 
 		 189 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  43.41 
 
 		 928 aa  82  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 894 aa  81.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  37.42 
 
 		 893 aa  81.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  32.24 
 
 		 1121 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  20 
 
 		 1932 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  32.11 
 
 		 940 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  30 
 
 		 855 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  31.76 
 
 		 955 aa  79  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.01 
 
 		 1780 aa  78.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  33.95 
 
 		 758 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 919 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  30.42 
 
 		 921 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  33.64 
 
 		 937 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 723 aa  78.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.72 
 
 		 1146 aa  78.2  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 921 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.88 
 
 		 1055 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  30.42 
 
 		 921 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 937 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  33.64 
 
 		 937 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  20.72 
 
 		 1805 aa  77.8  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  41.22 
 
 		 894 aa  77.8  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  28.99 
 
 		 1163 aa  77.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 910 aa  77.4  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.51 
 
 		 713 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 940 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 		 965 aa  75.5  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  40.08 
 
 		 1074 aa  75.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  38.41 
 
 		 929 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.43 
 
 		 1666 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 919 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  27.67 
 
 		 919 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 881 aa  72.8  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  30.51 
 
 		 921 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  62.07 
 
 		 963 aa  73.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.46 
 
 		 1080 aa  72.8  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.98 
 
 		 1780 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  37.76 
 
 		 911 aa  72.4  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 879 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.92 
 
 		 1795 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  39.19 
 
 		 913 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  36.33 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.78 
 
 		 1794 aa  71.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  30 
 
 		 1123 aa  71.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  34.47 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  25.96 
 
 		 1050 aa  71.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.96 
 
 		 1050 aa  71.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 927 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 950 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  46.39 
 
 		 913 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  36.91 
 
 		 995 aa  70.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 953 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  22.36 
 
 		 1057 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  34.28 
 
 		 1053 aa  70.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>