More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4595 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 336 aa  628  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  36.03 
 
 		 925 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 932 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  40.21 
 
 		 974 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 877 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  40.59 
 
 		 998 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  37.94 
 
 		 948 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  34.47 
 
 		 943 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  38.17 
 
 		 1104 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  41.81 
 
 		 946 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 908 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 951 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  29.13 
 
 		 855 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  45.26 
 
 		 956 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 994 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 941 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  56.45 
 
 		 931 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  35.63 
 
 		 1074 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  46.84 
 
 		 929 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  54.1 
 
 		 981 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.35 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  63.79 
 
 		 879 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 918 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  55 
 
 		 900 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  47.83 
 
 		 943 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 937 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  45.33 
 
 		 937 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  46.67 
 
 		 940 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  45.33 
 
 		 937 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  55.17 
 
 		 952 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  64.71 
 
 		 959 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 897 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 947 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  38.69 
 
 		 910 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 910 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  42.68 
 
 		 925 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  48.1 
 
 		 892 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 879 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 882 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 		 963 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 959 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.23 
 
 		 881 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  32.46 
 
 		 917 aa  60.1  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  55.93 
 
 		 960 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  42.67 
 
 		 930 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 1052 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 929 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.86 
 
 		 947 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  51.79 
 
 		 919 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  42.31 
 
 		 921 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  43.59 
 
 		 919 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 894 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  53.85 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  53.85 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 977 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  38.04 
 
 		 995 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  58.93 
 
 		 953 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 936 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  37.1 
 
 		 884 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 		 927 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  37.63 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  37.63 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 970 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 919 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  52.46 
 
 		 919 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  43.75 
 
 		 964 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  41.33 
 
 		 913 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  41.67 
 
 		 957 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.57 
 
 		 880 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 216 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  53.45 
 
 		 1001 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 916 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 		 876 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 923 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 881 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 881 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 876 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 887 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  54.55 
 
 		 776 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  48.33 
 
 		 758 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 818 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  56 
 
 		 937 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  58 
 
 		 919 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 937 aa  56.2  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.96 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 956 aa  56.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 927 aa  56.2  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>