More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2716 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
941 aa  1774    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  39.27 
 
 
925 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  36.07 
 
 
943 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 
931 aa  345  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
994 aa  279  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  33.26 
 
 
908 aa  278  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  33.55 
 
 
855 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 
1074 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 
951 aa  94.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  36.48 
 
 
948 aa  88.2  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 
946 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 
974 aa  81.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.12 
 
 
947 aa  78.2  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 
943 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 
932 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
877 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.79 
 
 
1193 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  34.77 
 
 
1104 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  28.91 
 
 
960 aa  71.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
952 aa  70.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  31.02 
 
 
1190 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.64 
 
 
947 aa  65.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.5 
 
 
1109 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 
925 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 
998 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  32.7 
 
 
336 aa  62  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  28.62 
 
 
970 aa  62  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.55 
 
 
1118 aa  61.6  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.76 
 
 
992 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 
995 aa  60.1  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  35.08 
 
 
940 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 
923 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
954 aa  59.3  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  50.98 
 
 
900 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.84 
 
 
713 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.76 
 
 
1075 aa  59.3  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  47.19 
 
 
876 aa  58.9  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  31.02 
 
 
723 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  34.27 
 
 
946 aa  58.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  42.86 
 
 
231 aa  57.8  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.17 
 
 
255 aa  57.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 
959 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  46.3 
 
 
919 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  31.13 
 
 
921 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  46.67 
 
 
929 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 
998 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  30.77 
 
 
892 aa  57  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.89 
 
 
983 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  28.26 
 
 
894 aa  56.6  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 
929 aa  57  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  29.71 
 
 
909 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 
908 aa  55.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  30 
 
 
924 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.33 
 
 
850 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  39.45 
 
 
1001 aa  55.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  49.09 
 
 
233 aa  54.7  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  27.85 
 
 
1151 aa  54.7  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 
228 aa  54.7  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
921 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  49.3 
 
 
921 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  49.3 
 
 
921 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 
903 aa  54.7  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.97 
 
 
938 aa  54.3  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 
210 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
919 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
421 aa  54.3  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 
901 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 
229 aa  54.3  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  48.21 
 
 
919 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  48.21 
 
 
919 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  33.89 
 
 
927 aa  53.9  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  27.32 
 
 
916 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 
973 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40 
 
 
505 aa  53.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 
913 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  25.52 
 
 
862 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
119 aa  53.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.12 
 
 
881 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 
215 aa  53.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  28.84 
 
 
982 aa  52.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  47.27 
 
 
212 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 
1015 aa  52.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1080  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  52.94 
 
 
823 aa  53.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.34 
 
 
1005 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.76 
 
 
900 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  32.53 
 
 
1054 aa  52.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 
865 aa  52.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
937 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 
937 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  47.27 
 
 
212 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 
937 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
217 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 
840 aa  52  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 
1089 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  32.81 
 
 
919 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 
217 aa  52  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 
912 aa  51.6  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  46.94 
 
 
227 aa  52  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 
910 aa  52  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
1000 aa  51.6  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>