More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1863 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  44.52 
 
 
919 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  48.34 
 
 
921 aa  705    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  44.52 
 
 
919 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  48.34 
 
 
921 aa  705    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
919 aa  1828    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  48.64 
 
 
921 aa  708    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  44.41 
 
 
919 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  48.56 
 
 
921 aa  707    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  48.03 
 
 
900 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  44.32 
 
 
977 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  77.61 
 
 
929 aa  1320    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 
923 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  30.27 
 
 
913 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  29.63 
 
 
884 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  29.56 
 
 
925 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  28.86 
 
 
940 aa  167  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  37.2 
 
 
916 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  28.95 
 
 
913 aa  164  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 
995 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  28.98 
 
 
934 aa  147  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  26.77 
 
 
920 aa  142  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  29.64 
 
 
889 aa  138  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 
916 aa  138  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  32.41 
 
 
922 aa  138  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 
997 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  29.48 
 
 
915 aa  133  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  27.37 
 
 
923 aa  131  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 
938 aa  119  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 
910 aa  117  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  39.9 
 
 
919 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 
923 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
928 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 
953 aa  108  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  25.2 
 
 
998 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  38.73 
 
 
913 aa  107  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  32.82 
 
 
930 aa  107  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  29.18 
 
 
879 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 
927 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 
928 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.36 
 
 
1006 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  31.83 
 
 
911 aa  100  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  33.6 
 
 
884 aa  99  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  34.54 
 
 
893 aa  98.6  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 
992 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
881 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
881 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
876 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 
929 aa  96.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  37.95 
 
 
909 aa  94  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  35.35 
 
 
917 aa  92.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 
894 aa  91.7  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  35.48 
 
 
541 aa  91.3  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  30.43 
 
 
928 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
544 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
544 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
544 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  29.36 
 
 
947 aa  90.1  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  35.48 
 
 
189 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  31.44 
 
 
955 aa  88.6  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
937 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  33.17 
 
 
937 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  31.84 
 
 
937 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  33.15 
 
 
910 aa  87  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
950 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  28.84 
 
 
905 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  31.64 
 
 
923 aa  85.5  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  25.61 
 
 
953 aa  85.5  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  31 
 
 
961 aa  85.1  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.49 
 
 
1029 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 
951 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  34.03 
 
 
1052 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  44.72 
 
 
946 aa  81.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 
998 aa  81.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
903 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  32.77 
 
 
959 aa  80.5  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  29.9 
 
 
892 aa  80.1  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  27.23 
 
 
918 aa  79.7  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.05 
 
 
713 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.15 
 
 
1015 aa  79  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  27.22 
 
 
970 aa  79  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 
960 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  27.63 
 
 
916 aa  78.2  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 
1064 aa  77.4  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  40.13 
 
 
932 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
1000 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  41.32 
 
 
877 aa  75.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 
974 aa  75.5  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.88 
 
 
947 aa  74.7  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 
948 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 
940 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 
952 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  25.5 
 
 
1204 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  33 
 
 
855 aa  71.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.53 
 
 
1075 aa  71.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  28.25 
 
 
946 aa  71.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 
897 aa  70.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.04 
 
 
1126 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  32.46 
 
 
973 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  29.66 
 
 
894 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.29 
 
 
1190 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>