More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0776 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
919 aa  669    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  99.57 
 
 
921 aa  1803    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  44.66 
 
 
919 aa  669    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  99.57 
 
 
921 aa  1803    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  48.28 
 
 
919 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  48.41 
 
 
921 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  44.33 
 
 
919 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
921 aa  1810    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  49.56 
 
 
900 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  48.03 
 
 
929 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  42.07 
 
 
977 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  27.93 
 
 
925 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  29.84 
 
 
923 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
889 aa  151  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 
916 aa  146  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  28.53 
 
 
917 aa  145  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  26.93 
 
 
920 aa  131  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  29.38 
 
 
961 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  29.3 
 
 
918 aa  129  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  32.36 
 
 
922 aa  129  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 
928 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 
995 aa  127  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  25.9 
 
 
998 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 
997 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
913 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  35.37 
 
 
884 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  26.37 
 
 
923 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 
915 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  35.51 
 
 
919 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  31.44 
 
 
923 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  28.05 
 
 
959 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  26.41 
 
 
927 aa  111  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  32.42 
 
 
930 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  26.91 
 
 
893 aa  107  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 
910 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  32.49 
 
 
934 aa  107  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  30.08 
 
 
913 aa  105  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  37.77 
 
 
884 aa  104  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  31.17 
 
 
928 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  31.12 
 
 
953 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  31.37 
 
 
955 aa  102  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  32.17 
 
 
879 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  29.75 
 
 
927 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 
940 aa  97.8  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  29.27 
 
 
918 aa  97.8  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  31.38 
 
 
928 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  31.63 
 
 
913 aa  94  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  31.59 
 
 
929 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  38.83 
 
 
909 aa  91.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 
910 aa  90.9  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 
916 aa  90.5  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.36 
 
 
1067 aa  90.1  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
881 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
881 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  30.71 
 
 
940 aa  89  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 
998 aa  87.8  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
937 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  32.95 
 
 
937 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 
894 aa  87.4  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
876 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  32.95 
 
 
937 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  25.99 
 
 
957 aa  85.1  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  26.16 
 
 
963 aa  85.1  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 
960 aa  84.7  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  26.98 
 
 
911 aa  84.7  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  45.65 
 
 
948 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 
938 aa  82.4  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
974 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.01 
 
 
1146 aa  82.4  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  31.26 
 
 
919 aa  81.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 
946 aa  82  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
1000 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 
897 aa  81.6  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 
992 aa  81.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  30.95 
 
 
923 aa  81.6  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  33.92 
 
 
189 aa  81.6  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 
927 aa  81.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  27.15 
 
 
900 aa  80.9  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  32.49 
 
 
892 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
541 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  45.69 
 
 
946 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 
932 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  40.72 
 
 
951 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.1 
 
 
1118 aa  78.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.13 
 
 
1190 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 
973 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
877 aa  77.8  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 
1015 aa  76.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 
903 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 
929 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  41.1 
 
 
936 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 
966 aa  76.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
950 aa  75.5  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  26.96 
 
 
907 aa  75.5  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 
982 aa  75.5  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  25.5 
 
 
1216 aa  74.7  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 
1064 aa  74.7  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  29.95 
 
 
963 aa  74.3  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  25.7 
 
 
1029 aa  74.3  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
544 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>