More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0215 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  100 
 
 		 1163 aa  2240    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  39.24 
 
 		 1139 aa  366  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  34.82 
 
 		 1143 aa  315  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 1089 aa  298  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  33.18 
 
 		 1083 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 648 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  35.9 
 
 		 647 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.38 
 
 		 1029 aa  228  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  35.7 
 
 		 647 aa  224  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.39 
 
 		 1055 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.3 
 
 		 1013 aa  181  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.77 
 
 		 713 aa  170  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.9 
 
 		 1067 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 1190 aa  151  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.18 
 
 		 1034 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.57 
 
 		 1193 aa  138  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.23 
 
 		 1666 aa  127  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.65 
 
 		 1075 aa  124  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  32.89 
 
 		 996 aa  114  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 1216 aa  108  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.05 
 
 		 494 aa  105  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 1064 aa  104  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  36.07 
 
 		 992 aa  103  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 1151 aa  102  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.65 
 
 		 1044 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 1141 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.37 
 
 		 1056 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.29 
 
 		 1050 aa  97.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 973 aa  95.1  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  21.48 
 
 		 1826 aa  95.1  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 1235 aa  94.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.29 
 
 		 1126 aa  93.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.23 
 
 		 1148 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  26.49 
 
 		 911 aa  91.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.78 
 
 		 1081 aa  88.6  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  31.6 
 
 		 957 aa  87  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.46 
 
 		 1429 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.01 
 
 		 967 aa  86.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.79 
 
 		 1080 aa  86.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 1015 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 954 aa  85.9  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  30.86 
 
 		 963 aa  85.1  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  27.86 
 
 		 1118 aa  85.1  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  31.9 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.12 
 
 		 1123 aa  84.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.25 
 
 		 900 aa  84.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.5 
 
 		 1055 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  25.35 
 
 		 1183 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.63 
 
 		 1422 aa  82  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  26.45 
 
 		 1123 aa  81.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  24.65 
 
 		 1050 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.65 
 
 		 1050 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  23.64 
 
 		 1055 aa  80.1  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 927 aa  79.7  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  26.49 
 
 		 2272 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 1141 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 1141 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 1141 aa  79  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  27.86 
 
 		 1109 aa  79  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.21 
 
 		 1014 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 1007 aa  78.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.04 
 
 		 1468 aa  78.2  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  25.53 
 
 		 1123 aa  77.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.76 
 
 		 1053 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  26.65 
 
 		 959 aa  77  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.39 
 
 		 1663 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  27.44 
 
 		 1029 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 1118 aa  76.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  28.49 
 
 		 1145 aa  76.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.09 
 
 		 1089 aa  76.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  24.46 
 
 		 1122 aa  76.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  31.17 
 
 		 963 aa  75.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.04 
 
 		 1360 aa  75.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.47 
 
 		 1005 aa  75.5  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  26.3 
 
 		 2279 aa  75.5  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.28 
 
 		 1046 aa  75.1  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  24.03 
 
 		 1093 aa  75.1  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  26.59 
 
 		 1022 aa  74.3  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.43 
 
 		 1117 aa  73.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 723 aa  73.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 636 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.33 
 
 		 1142 aa  72.4  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  26.08 
 
 		 1146 aa  71.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.97 
 
 		 1148 aa  71.2  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 		 1094 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.7 
 
 		 1295 aa  71.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.96 
 
 		 1175 aa  71.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.42 
 
 		 1668 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  28.84 
 
 		 916 aa  70.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  24.64 
 
 		 2303 aa  69.7  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 1101 aa  69.3  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.83 
 
 		 1264 aa  68.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 1422 aa  68.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.01 
 
 		 1291 aa  68.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 1217 aa  68.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  25.04 
 
 		 786 aa  67.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  26.41 
 
 		 1150 aa  67.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  28.18 
 
 		 940 aa  67  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1313 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0014  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.62 
 
 		 261 aa  67.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>