More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0788 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  59.87 
 
 		 1313 aa  1326    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1101 aa  2269    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  70.39 
 
 		 1063 aa  1535    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1238 aa  291  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  44.49 
 
 		 782 aa  249  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1060 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  41.57 
 
 		 985 aa  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  41.8 
 
 		 828 aa  195  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.31 
 
 		 991 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  35.31 
 
 		 1266 aa  188  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  37.64 
 
 		 1914 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 412 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 1714 aa  180  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 408 aa  163  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  32.99 
 
 		 957 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  36.95 
 
 		 343 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  34.93 
 
 		 340 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.25 
 
 		 725 aa  151  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  39.3 
 
 		 454 aa  151  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 1526 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.37 
 
 		 825 aa  144  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 1596 aa  139  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  31.44 
 
 		 941 aa  139  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  22.9 
 
 		 1611 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 438 aa  137  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 923 aa  137  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1261 aa  135  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.27 
 
 		 2145 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  31.75 
 
 		 689 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.88 
 
 		 809 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1550 aa  132  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  34.22 
 
 		 1009 aa  130  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 949 aa  129  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.63 
 
 		 852 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1450 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1298 aa  120  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.85 
 
 		 1186 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  32.45 
 
 		 1404 aa  116  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 751 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.74 
 
 		 609 aa  115  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1039 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  24.61 
 
 		 490 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  29.36 
 
 		 1021 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  27.27 
 
 		 364 aa  112  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 760 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  29.27 
 
 		 834 aa  111  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 771 aa  111  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.99 
 
 		 1424 aa  110  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.15 
 
 		 971 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  26.62 
 
 		 816 aa  110  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1025 aa  109  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.26 
 
 		 1295 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  30.61 
 
 		 1147 aa  106  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 924 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  22.9 
 
 		 999 aa  106  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 850 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  29.27 
 
 		 755 aa  105  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.8 
 
 		 787 aa  104  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  25.45 
 
 		 1020 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 444 aa  102  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  26.72 
 
 		 991 aa  102  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  29.79 
 
 		 357 aa  102  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.69 
 
 		 732 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2620  Tetratricopeptide TPR_4  29.48 
 
 		 303 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.866097  normal  0.0216756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.75 
 
 		 1162 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 966 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  30.51 
 
 		 493 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 545 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 911 aa  99.4  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 659 aa  98.2  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  28.32 
 
 		 740 aa  98.2  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1162 aa  97.8  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1285 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 1071 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1212 aa  97.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 568 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.36 
 
 		 568 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 649 aa  95.9  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  30.32 
 
 		 311 aa  95.5  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 		 667 aa  95.1  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  26.76 
 
 		 981 aa  95.1  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  31.8 
 
 		 362 aa  95.1  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  23.1 
 
 		 671 aa  94.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  23.58 
 
 		 945 aa  94  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.56 
 
 		 885 aa  94  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  25.82 
 
 		 650 aa  94.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  25.52 
 
 		 1054 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  28.06 
 
 		 1013 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  30.77 
 
 		 680 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 258 aa  93.2  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  27.35 
 
 		 775 aa  93.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 809 aa  92.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 368 aa  92.4  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  27.82 
 
 		 836 aa  92.4  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1958 aa  92.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 287 aa  91.7  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 669 aa  91.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 284 aa  91.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.8 
 
 		 767 aa  90.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 		 636 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>