More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5154 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1596 aa  3234    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  34.77 
 
 
1914 aa  644    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
1714 aa  594  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  35.64 
 
 
1238 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.91 
 
 
782 aa  207  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  30.8 
 
 
941 aa  206  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 
1526 aa  195  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
1313 aa  179  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.08 
 
 
1507 aa  174  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
1450 aa  168  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  28.74 
 
 
1266 aa  166  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  31.24 
 
 
1215 aa  166  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  39.14 
 
 
454 aa  166  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
1261 aa  156  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
1060 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  29.7 
 
 
1328 aa  150  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 
991 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  28.8 
 
 
1044 aa  147  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.96 
 
 
787 aa  144  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.65 
 
 
725 aa  144  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
1101 aa  138  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 
771 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
924 aa  134  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
1105 aa  132  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 
636 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.22 
 
 
985 aa  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 
1279 aa  126  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  38.78 
 
 
490 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
1285 aa  124  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.92 
 
 
1009 aa  121  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 
1288 aa  120  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.51 
 
 
1424 aa  121  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  28.55 
 
 
799 aa  121  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 
911 aa  121  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
568 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 
568 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.76 
 
 
1186 aa  120  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 
444 aa  115  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.29 
 
 
767 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
1063 aa  111  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.28 
 
 
2145 aa  107  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.47 
 
 
885 aa  107  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.69 
 
 
957 aa  106  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.72 
 
 
999 aa  103  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.3 
 
 
1291 aa  102  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
843 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.44 
 
 
828 aa  98.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  19.38 
 
 
1180 aa  96.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  34.8 
 
 
672 aa  95.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
1298 aa  95.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.05 
 
 
1295 aa  92  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.55 
 
 
1039 aa  91.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  29.05 
 
 
827 aa  90.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 
751 aa  89.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.82 
 
 
1429 aa  89.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  26.81 
 
 
834 aa  88.6  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.56 
 
 
689 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
408 aa  88.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
809 aa  87  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  26.81 
 
 
1021 aa  86.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  26.85 
 
 
708 aa  85.5  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  25.09 
 
 
340 aa  84.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  35.59 
 
 
977 aa  85.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
343 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.02 
 
 
1131 aa  84  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  29.81 
 
 
493 aa  84.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  28.5 
 
 
694 aa  84  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 
776 aa  83.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
649 aa  82.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 
872 aa  82.4  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.63 
 
 
1195 aa  82  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  28.88 
 
 
828 aa  82  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
284 aa  82  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.08 
 
 
609 aa  81.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  24.92 
 
 
1022 aa  81.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
1298 aa  81.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  23.89 
 
 
1119 aa  81.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
945 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  28.35 
 
 
848 aa  80.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 
1050 aa  80.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  26.85 
 
 
816 aa  79.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 
923 aa  79.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.72 
 
 
822 aa  79.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
798 aa  79.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  24.72 
 
 
357 aa  79  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
368 aa  78.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  26.51 
 
 
971 aa  78.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.78 
 
 
991 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.51 
 
 
560 aa  77.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
412 aa  77.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
953 aa  77.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  28.16 
 
 
1104 aa  77  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  29.68 
 
 
975 aa  77  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.02 
 
 
965 aa  76.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.48 
 
 
667 aa  76.3  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  32.24 
 
 
825 aa  76.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
1162 aa  76.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.44 
 
 
1162 aa  75.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.57 
 
 
1422 aa  75.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>