More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1591 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 412 aa  824    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  43.92 
 
 		 1060 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.44 
 
 		 991 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  40.59 
 
 		 828 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  36.15 
 
 		 782 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 1313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  37.37 
 
 		 1266 aa  196  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 1101 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  34.34 
 
 		 985 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1238 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  36.19 
 
 		 2145 aa  169  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1550 aa  167  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  39.62 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.3 
 
 		 1162 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 1162 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  32.45 
 
 		 725 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 1063 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 1450 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 408 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 923 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  30.17 
 
 		 1914 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  29.08 
 
 		 957 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  30.82 
 
 		 809 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.64 
 
 		 1186 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.97 
 
 		 1279 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  36.98 
 
 		 1228 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1714 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.72 
 
 		 636 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 438 aa  122  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  28.78 
 
 		 689 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 949 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 1261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  29.34 
 
 		 1009 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 1025 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.92 
 
 		 609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 1048 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  32.39 
 
 		 825 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  26.8 
 
 		 941 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  27.52 
 
 		 1020 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  26.57 
 
 		 788 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 852 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 649 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  31.47 
 
 		 755 aa  99.8  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  30.07 
 
 		 740 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 760 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.25 
 
 		 732 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  23.15 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  30.69 
 
 		 493 aa  97.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.69 
 
 		 1021 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 545 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 1071 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  28.14 
 
 		 1054 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  29.52 
 
 		 981 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.01 
 
 		 694 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  27.82 
 
 		 971 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  26.25 
 
 		 1025 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  28.18 
 
 		 775 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  28.41 
 
 		 790 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 639 aa  90.1  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  31.6 
 
 		 1106 aa  89.7  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.55 
 
 		 1468 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  27.91 
 
 		 807 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.35 
 
 		 965 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 		 1288 aa  87  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  25.43 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1054 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.35 
 
 		 1424 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  31.8 
 
 		 836 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  26.23 
 
 		 671 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  28.62 
 
 		 708 aa  84  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2412  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 857 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.22 
 
 		 1295 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.69 
 
 		 1360 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  24.66 
 
 		 1147 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.61 
 
 		 1328 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 659 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1298 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 1195 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  27.8 
 
 		 1022 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.69 
 
 		 560 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  27.15 
 
 		 931 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  31.09 
 
 		 695 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1526 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.66 
 
 		 1040 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0030  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  28.38 
 
 		 1507 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  28.38 
 
 		 2327 aa  79.7  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  28.17 
 
 		 919 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  32.45 
 
 		 928 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  26.64 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  30.43 
 
 		 991 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  28.41 
 
 		 941 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.29 
 
 		 2413 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>