More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38879 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  100 
 
 
807 aa  1681    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.67 
 
 
740 aa  154  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  29.06 
 
 
694 aa  150  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.33 
 
 
2145 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.55 
 
 
1040 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25 
 
 
1328 aa  132  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
1215 aa  131  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.5 
 
 
1186 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.34 
 
 
1404 aa  127  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  25.29 
 
 
708 aa  127  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.21 
 
 
1550 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  25.44 
 
 
686 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  24.86 
 
 
825 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 
767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 
843 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 
771 aa  117  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  25.56 
 
 
836 aa  117  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.33 
 
 
782 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  22.73 
 
 
725 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  22.11 
 
 
1507 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.94 
 
 
1288 aa  114  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
454 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
911 aa  112  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.32 
 
 
2327 aa  111  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.97 
 
 
1424 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 
568 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
568 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43024  predicted protein  26.51 
 
 
576 aa  107  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000321984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.14 
 
 
732 aa  107  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
924 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
444 aa  104  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.82 
 
 
787 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.92 
 
 
1238 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.26 
 
 
493 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  25.1 
 
 
1290 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  20.24 
 
 
1044 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  20.94 
 
 
799 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
1105 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.77 
 
 
672 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  24.84 
 
 
919 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  21.26 
 
 
1050 aa  96.3  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  26.46 
 
 
1429 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
949 aa  95.9  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
443 aa  91.3  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
1088 aa  90.9  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
190 aa  90.1  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
857 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
991 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
412 aa  88.2  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.25 
 
 
885 aa  88.6  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  25.15 
 
 
1914 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.16 
 
 
1131 aa  86.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
1060 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
649 aa  86.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  22.86 
 
 
1039 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
751 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
481 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  24.15 
 
 
1106 aa  86.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  23.28 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
1714 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  29.01 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
785 aa  84  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.33 
 
 
2413 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.3 
 
 
667 aa  81.6  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
639 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  21.76 
 
 
977 aa  81.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  23.83 
 
 
731 aa  80.9  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.69 
 
 
991 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.08 
 
 
854 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5384  serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 
1109 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00425552  normal  0.786393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 
919 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  21.74 
 
 
757 aa  80.1  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.2 
 
 
1036 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  22.84 
 
 
1212 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
1261 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  25.74 
 
 
665 aa  78.2  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  24.15 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.23 
 
 
957 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.03 
 
 
810 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 
1486 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  24.81 
 
 
680 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  23.58 
 
 
828 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  25.14 
 
 
1068 aa  74.7  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  18.78 
 
 
1262 aa  74.3  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
1028 aa  74.3  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
1450 aa  74.3  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 
1435 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
438 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 
953 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
669 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  20.91 
 
 
822 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
814 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
448 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
776 aa  71.2  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  21.8 
 
 
733 aa  71.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  21.8 
 
 
1266 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43236  predicted protein  24.51 
 
 
1452 aa  71.2  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.466991  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
909 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
1313 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>