168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43236 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43236  predicted protein  100 
 
 		 1452 aa  2975    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.466991  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  25.29 
 
 		 2327 aa  351  8e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.87 
 
 		 2145 aa  113  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.89 
 
 		 782 aa  89.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1550 aa  86.7  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.23 
 
 		 1328 aa  81.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1238 aa  80.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  22.31 
 
 		 694 aa  78.6  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  22.92 
 
 		 740 aa  75.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.41 
 
 		 771 aa  75.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1404 aa  75.1  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 767 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1215 aa  71.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  22.26 
 
 		 799 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.68 
 
 		 809 aa  71.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  24.51 
 
 		 807 aa  71.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  25.84 
 
 		 1106 aa  70.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  22.13 
 
 		 1507 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1068 aa  70.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  24.21 
 
 		 825 aa  70.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  24.01 
 
 		 708 aa  69.3  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.39 
 
 		 1288 aa  69.3  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.44 
 
 		 1060 aa  68.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  25 
 
 		 919 aa  68.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.2 
 
 		 1186 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.31 
 
 		 493 aa  67.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  21.58 
 
 		 1040 aa  67  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  25.7 
 
 		 1429 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  25.82 
 
 		 985 aa  66.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25.56 
 
 		 1611 aa  65.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  22.2 
 
 		 836 aa  65.9  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3789  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.21 
 
 		 732 aa  64.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.28 
 
 		 1694 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1092  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 425 aa  64.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1025 aa  63.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  23.31 
 
 		 828 aa  63.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.66 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1039 aa  62.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2413 aa  62.4  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 1105 aa  62.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1212 aa  62.4  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 949 aa  62.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  23.71 
 
 		 1131 aa  62  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27 
 
 		 725 aa  61.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 481 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.3 
 
 		 991 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.06 
 
 		 787 aa  60.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.9 
 
 		 854 aa  60.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  20.37 
 
 		 1313 aa  60.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.48 
 
 		 1228 aa  60.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.81 
 
 		 919 aa  59.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.3 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  24.37 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.37 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.98 
 
 		 991 aa  58.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 444 aa  58.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 843 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 		 1101 aa  58.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.21 
 
 		 667 aa  58.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 751 aa  57  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.49 
 
 		 822 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.48 
 
 		 957 aa  57.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.62 
 
 		 1424 aa  57  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 		 1261 aa  57.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.45 
 
 		 816 aa  56.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1676 aa  56.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 412 aa  55.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  21.77 
 
 		 1262 aa  55.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 3145 aa  55.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42809  predicted protein  27.65 
 
 		 323 aa  55.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.11 
 
 		 1000 aa  55.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1082 aa  54.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  24.09 
 
 		 1056 aa  55.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 4079 aa  53.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 857 aa  54.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 1290 aa  53.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  23.16 
 
 		 833 aa  53.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.36 
 
 		 885 aa  53.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25.94 
 
 		 672 aa  52.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  20.31 
 
 		 810 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  29.94 
 
 		 490 aa  51.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  21.61 
 
 		 689 aa  51.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46231  predicted protein  24.05 
 
 		 557 aa  51.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48951  predicted protein  25.34 
 
 		 445 aa  51.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  19.76 
 
 		 1914 aa  51.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 		 1479 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5235  predicted protein  21.85 
 
 		 236 aa  51.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.929624  normal  0.933998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.53 
 
 		 1162 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  22.99 
 
 		 311 aa  50.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.93 
 
 		 2240 aa  50.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  20.78 
 
 		 1526 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 911 aa  50.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 814 aa  50.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 637 aa  50.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 927 aa  50.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>