184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42809 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42809  predicted protein  100 
 
 
323 aa  672    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767843  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.65 
 
 
2145 aa  86.7  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  31.02 
 
 
694 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.99 
 
 
1328 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
843 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.19 
 
 
919 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  28 
 
 
740 aa  72.8  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.08 
 
 
1550 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.65 
 
 
825 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
454 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  30.27 
 
 
836 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.75 
 
 
732 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.05 
 
 
1212 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  29.25 
 
 
1404 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 
1290 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
1105 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 
771 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
949 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
924 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
481 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.98 
 
 
1238 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
1215 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  25 
 
 
2327 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.98 
 
 
493 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
1186 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  25.5 
 
 
680 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
639 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  28.47 
 
 
708 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25.17 
 
 
2413 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  31.01 
 
 
1131 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  32.45 
 
 
1731 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  29.7 
 
 
1123 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 
568 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.17 
 
 
568 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  34.51 
 
 
686 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 
885 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.16 
 
 
767 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  28.37 
 
 
650 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 
957 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25.77 
 
 
672 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42451  predicted protein  32.8 
 
 
681 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 
1288 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
444 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
284 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.29 
 
 
787 aa  59.7  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  26.84 
 
 
362 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.17 
 
 
809 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.78 
 
 
1228 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.36 
 
 
782 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  27.69 
 
 
1106 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  26.97 
 
 
807 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  28.97 
 
 
919 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43024  predicted protein  27.44 
 
 
576 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000321984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 
828 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  27.27 
 
 
718 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
1313 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
1063 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  26.21 
 
 
822 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  27.81 
 
 
490 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 
1279 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.85 
 
 
550 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
649 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.87 
 
 
1040 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  31.25 
 
 
1147 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
1101 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43236  predicted protein  27.65 
 
 
1452 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.466991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
911 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
751 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 
1424 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48781  predicted protein  24.83 
 
 
439 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0840709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
850 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0071  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
617 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0689126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.5 
 
 
1039 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  28.67 
 
 
364 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
436 aa  53.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
659 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48337  predicted protein  24.85 
 
 
678 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.48 
 
 
1694 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.14 
 
 
725 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
543 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 
667 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  22.81 
 
 
1507 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  25.34 
 
 
977 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.4 
 
 
1291 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
1479 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.23 
 
 
854 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
1060 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  25.44 
 
 
1044 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  24.06 
 
 
799 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  28.07 
 
 
1429 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.45 
 
 
636 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
1261 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0979  GGDEF family protein  25 
 
 
667 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
1285 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
1025 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
412 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48951  predicted protein  26.92 
 
 
445 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  26.83 
 
 
757 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>