223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46231 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46231  predicted protein  100 
 
 
557 aa  1145    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.78 
 
 
1238 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34196  predicted protein  26.83 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  30.43 
 
 
2145 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.87 
 
 
782 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  25.69 
 
 
836 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.19 
 
 
852 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.35 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.11 
 
 
825 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.97 
 
 
740 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.92 
 
 
957 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  25.65 
 
 
822 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  23.79 
 
 
2327 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
1101 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
1060 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.48 
 
 
1550 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
632 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  26.97 
 
 
650 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25 
 
 
725 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
833 aa  63.9  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
392 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.19 
 
 
828 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.97 
 
 
746 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
1526 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.03 
 
 
694 aa  60.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 
629 aa  60.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
649 aa  60.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.36 
 
 
1131 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.06 
 
 
991 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  29.09 
 
 
708 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
639 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
635 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  26.84 
 
 
725 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
635 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  28.99 
 
 
686 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.94 
 
 
810 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
878 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.35 
 
 
1154 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.79 
 
 
985 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
1063 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  25.31 
 
 
1087 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
612 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
611 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
1285 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  30.23 
 
 
1180 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.8 
 
 
1009 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
637 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.47 
 
 
1040 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
250 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  27.45 
 
 
490 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  30 
 
 
830 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  26.09 
 
 
695 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
636 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  21.6 
 
 
340 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.27 
 
 
755 aa  55.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  23.68 
 
 
807 aa  54.3  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.34 
 
 
784 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  23.81 
 
 
585 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.53 
 
 
1404 aa  53.9  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  25.33 
 
 
1147 aa  53.9  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
809 aa  53.9  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
949 aa  53.9  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.85 
 
 
875 aa  53.5  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.61 
 
 
1914 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  25.87 
 
 
750 aa  53.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 
250 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
750 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
1261 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  28.36 
 
 
1826 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.63 
 
 
2413 aa  52.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
412 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 
466 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 
988 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 
1313 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43236  predicted protein  24.05 
 
 
1452 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.466991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.65 
 
 
809 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
847 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
465 aa  51.2  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1252 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.47 
 
 
1000 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1601  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 
355 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.799203  unclonable  3.52104e-23 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 
626 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
534 aa  50.8  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
614 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
343 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1252 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
614 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
1056 aa  50.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
533 aa  50.4  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 
1082 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
1450 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
573 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.67 
 
 
1266 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25 
 
 
1611 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 
597 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.59 
 
 
1288 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.17 
 
 
626 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3274  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
416 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
614 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.17 
 
 
614 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>