More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0982 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  100 
 
 
750 aa  1543    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.81 
 
 
1056 aa  232  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  45.11 
 
 
1022 aa  231  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.01 
 
 
988 aa  226  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.74 
 
 
818 aa  223  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.85 
 
 
784 aa  221  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  42.45 
 
 
649 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.78 
 
 
1056 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  42.09 
 
 
462 aa  203  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  43.38 
 
 
617 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  42.55 
 
 
706 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 
927 aa  194  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.11 
 
 
810 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  39.42 
 
 
706 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.32 
 
 
357 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  40.41 
 
 
392 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  37.28 
 
 
361 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.93 
 
 
878 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  40.37 
 
 
306 aa  170  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  39.63 
 
 
334 aa  170  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  42.67 
 
 
352 aa  167  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 
391 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.31 
 
 
746 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 
425 aa  163  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  40.55 
 
 
331 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.13 
 
 
632 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  40.16 
 
 
582 aa  161  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  39.3 
 
 
349 aa  160  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 
280 aa  160  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  38.38 
 
 
581 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
1421 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
605 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  39.39 
 
 
820 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
547 aa  158  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 
279 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
1276 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.62 
 
 
629 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.61 
 
 
308 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.32 
 
 
738 aa  155  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
687 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 
356 aa  152  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
284 aa  150  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 
428 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
371 aa  149  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 
301 aa  148  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  36.29 
 
 
539 aa  147  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 
318 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
543 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 
308 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.09 
 
 
839 aa  146  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
833 aa  144  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
804 aa  144  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
291 aa  144  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 
446 aa  144  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  41.62 
 
 
280 aa  143  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  37.73 
 
 
295 aa  143  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  32.39 
 
 
1007 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.59 
 
 
406 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.59 
 
 
406 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 
515 aa  141  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.02 
 
 
1694 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.98 
 
 
778 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.65 
 
 
471 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  37.27 
 
 
295 aa  139  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.3 
 
 
261 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.21 
 
 
373 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  39.3 
 
 
260 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 
543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  32.14 
 
 
442 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.13 
 
 
542 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  34.8 
 
 
269 aa  137  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  37.07 
 
 
306 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 
593 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 
292 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 
306 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
3145 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 
1192 aa  135  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 
301 aa  134  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
1827 aa  134  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
4079 aa  134  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.56 
 
 
397 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
292 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  33.88 
 
 
573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
404 aa  133  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 
295 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
289 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.67 
 
 
286 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.39 
 
 
289 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 
512 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.2 
 
 
707 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 
290 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
602 aa  128  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 
376 aa  129  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.42 
 
 
576 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
4489 aa  128  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
615 aa  128  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 
286 aa  127  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.67 
 
 
286 aa  127  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
3035 aa  126  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
615 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>