More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1501 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
629 aa  1269    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 
315 aa  197  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
371 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 
384 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2366  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
479 aa  137  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.062914  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
878 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.46 
 
 
810 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.44 
 
 
632 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.34 
 
 
1056 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 
649 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.45 
 
 
887 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 
988 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  29.41 
 
 
321 aa  101  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
594 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 
1022 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.57 
 
 
818 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 
3145 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  28.17 
 
 
344 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 
784 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.23 
 
 
340 aa  91.3  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
711 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
3301 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
4079 aa  90.5  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
1094 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.38 
 
 
1056 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 
1737 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.39 
 
 
626 aa  88.6  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.25 
 
 
1694 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.63 
 
 
875 aa  87  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 
3035 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
847 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
3172 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.61 
 
 
626 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
927 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
4489 aa  85.1  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.03 
 
 
820 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
589 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.11 
 
 
884 aa  84  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 
689 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
714 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
351 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.2 
 
 
626 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.16 
 
 
1979 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
573 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
646 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
649 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.93 
 
 
603 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
649 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
639 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
3560 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  24.13 
 
 
648 aa  81.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
614 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
614 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 
686 aa  80.9  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
824 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.14 
 
 
620 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
620 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
1276 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.02 
 
 
733 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 
636 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.07 
 
 
614 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 
1056 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.07 
 
 
614 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
614 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
685 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
637 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
718 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
356 aa  77  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
654 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
716 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.65 
 
 
714 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.35 
 
 
832 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.03 
 
 
681 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
637 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 
681 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
767 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
543 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
2262 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  26.8 
 
 
676 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.03 
 
 
1154 aa  73.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
2262 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  25.63 
 
 
743 aa  73.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
331 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
612 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.64 
 
 
2240 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
301 aa  73.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 
586 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.8 
 
 
254 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
567 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
409 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
572 aa  73.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
543 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>